如何獲取R中區間數據的直方圖狀摘要?區間數據的類似於直方圖的摘要
我的MWE數據有四個區間。
interval range
Int1 2-7
Int2 10-14
Int3 12-18
Int4 25-28
我想要一個直方圖類函數來計算Int1-Int4間隔如何跨越固定大小的二進制分割的範圍。 該函數輸出應該是這樣的:
bin count which
[0-4] 1 Int1
[5-9] 1 Int1
[10-14] 2 Int2 and Int3
[15-19] 1 Int3
[20-24] 0 None
[25-29] 1 Int4
在這裏,範圍爲[minfloor(INT1,INT2,INT3,Int40),maxceil(INT1,INT2,INT3,INT4))= [0,30)和有六個倉的大小= 5.
我將非常感謝R包或函數,實現我想要的功能的任何指針。
更新:
到目前爲止,我已經從使用快速的數據結構,稱爲NCLIST,這比根據用戶區間檢索樹快IRanges包的解決方案。
> library(IRanges)
> subject <- IRanges(c(2,10,12,25), c(7,14,18,28))
> query <- IRanges(c(0,5,10,15,20,25), c(4,9,14,19,24,29))
> countOverlaps(query, subject)
[1] 1 1 2 1 0 1
但我仍然無法得到哪些是重疊的範圍。如果通過,我會更新。
你用'table'試過了嗎? – akrun
我試過了表,但不能超越對每個範圍終點的查詢的天真執行,即如果j> k且i
nandu
您的預期輸出是基於輸入示例嗎?我會嘗試用'休息'來削減'''' – akrun