我有一個data.h5文件組織成多個塊,整個文件有幾百吉字節。我需要以Pandas DataFrame的形式在內存中處理文件的過濾子集。 以下例程的目標是將篩選工作分佈到多個進程,然後將篩選結果連接到最終的DataFrame中。 由於從文件讀取需要大量的時間,我試圖讓每個進程都以併發的方式讀取自己的塊。 import multiprocessing as mp, pandas as pd
st
我有一個問題,計算numpy中的數組的平均值,對RAM(〜100G)來說太大。 我已經研究過使用np.memmap,但不幸的是我的數組被存儲爲HDF5文件中的數據集。根據我的嘗試,np.memmap不接受hdf5數據集作爲輸入。 TypeError: coercing to Unicode: need string or buffer, Dataset found 那麼我怎樣才能以高效的方式在磁盤
我試圖從許多HDF5文件中提取值並將其存儲在列表中。 import h5py
h = [h5py.File('filenum_%s.h5' % (n),'r')['key'][10][10] for n in range(100)]
這個列表解析包含從HDF5文件filenum0.h5 'key' 的陣列中的網格點(10,10)的值 - filenum99.h5。 它的工作原理,但它停止與周
我一直在使用SMAP數據衛星,專門用於溼度和土壤比例。 我按照使用的想法GDAL解決一切,並與此類似刊登在Link to first approach to download SMAP data 對矯正代碼和測試的東西: import os
import h5py
import numpy as np
from osgeo import gdal, gdal_array, osr
我有具有3點矩陣A,B,C. 其實我使用scipy.io到如下導入此墊文件.MAT文件導入.MAT-7.3版文件。 data = sio.loadmat('/data.mat')
A = data['A']
B = data['B']
C = data['C']
但是,v7.3文件不能使用這種方式導入。 所以,我試圖導入使用h5py,但我不知道如何使用h5py。 我的代碼如下。 f =
我從HDF5文件中提取numpy數據(所有非零浮點數),然後將其轉換爲熊貓數據幀,然後嘗試顯示數據裏面,但這是失敗的。我在Jupyter筆記本上做了所有這些。 import h5py # necessary for storing
import pandas as pd
from IPython.display import display, HTML
h5 = h5py.File('so