將數據幀轉換爲矩陣，並將第1列的df作爲矩陣的rownames

我有一個尺寸爲3695 X 20的數據框。第一列包含字母數字標識符，其他19列均爲數字。因此，rownames（df）提供數字1-3695，而colnames（df）提供列的名稱。 df [，1]提供字母數字標識符。將數據幀轉換爲矩陣，並將第1列的df作爲矩陣的rownames

我想將數據框轉換爲矩陣，並使用現有數據框的第1列作爲新矩陣的rownames，並將數據框的列名稱作爲矩陣的列名。

我也想自動化這個過程，用於類似但不同維度的數據幀。因此，如果解決方案需要知道行數和/或列數，那麼我怎樣才能將這些信息放入代碼中，而無需查看顯示器？

我看過data.matrix和reshape2，但似乎無法弄清楚如何做我想做的事。

來源

2014-09-05 Matthew

等待你說第一列包含標識符，但也包含'rownames（df）'標識符。有不一樣的東西。 'rownames（）'不作爲列存儲，它們作爲屬性存儲。那麼你的數據的情況如何？你是否簡單地複製了信息。你真的應該添加一個[可重現的例子]（http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example）來明確你的輸入是什麼以及你想要什麼輸出是。如果這是唯一的問題，您可以使用dim（），nrow（）或ncol（）來獲取data.frame的維度。 – MrFlick 2014-09-05 21:56:19

對不起，我的錯誤，rownames（df）只是一個數字列表; 1-3695。 – Matthew 2014-09-05 22:37:49

如果在你的問題中有錯誤，你應該編輯它。再說一遍，如果沒有一個可重複的例子，回答並不是很有趣，因爲我們最終會浪費大量時間來創建一個，而我們的數據可能會或可能不會匹配您的數據。參見[如何提出一個好問題]（http://stackoverflow.com/help/how-to-ask）。 – MrFlick 2014-09-05 22:47:47

與樣品數據

X<-structure(list(gene = c("AT1G01040", "AT1G01270", "AT1G01471", "AT1G01680"), log2.fold_change._Mer7_2.1_Mer7_2.2 = c(0, 0, 0, 0), log2.fold_change._Mer7_1.2_W29_S226A_1 = c(0, 0, -1.14, 0), log2.fold_change._Mer7_1.2_W29_1 = c(0, 0, 0, 0)), .Names = c("gene", "log2.fold_change._Mer7_2.1_Mer7_2.2", "log2.fold_change._Mer7_1.2_W29_S226A_1", "log2.fold_change._Mer7_1.2_W29_1"), row.names = c(NA, 4L), class = "data.frame")

您可以編寫一個簡單的輔助函數來創建一個矩陣並設置正確的名稱

matrix.please<-function(x) { 
    m<-as.matrix(x[,-1]) 
    rownames(m)<-x[,1] 
    m 
}

，你會使用它像

M <- matrix.please(X) 
str(M) 
# num [1:4, 1:3] 0 0 0 0 0 0 -1.14 0 0 0 ... 
# - attr(*, "dimnames")=List of 2 
# ..$ : chr [1:4] "AT1G01040" "AT1G01270" "AT1G01471" "AT1G01680" 
# ..$ : chr [1:3] "log2.fold_change._Mer7_2.1_Mer7_2.2" 
# "log2.fold_change._Mer7_1.2_W29_S226A_1" "log2.fold_change._Mer7_1.2_W29_1"

所以我們有一個4x3矩陣，其中包含正確的行和列名。

來源

2014-09-05 23:18:09 MrFlick

將數據幀轉換爲矩陣，並將第1列的df作爲矩陣的rownames

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