將RleViews轉換爲矩陣

Question

將RleViews對象（包含相同長度的元素）轉換爲矩陣對象有更快的方法嗎？

我通常使用

viewApply(x, as.vector) 

TNX！

Answer 1

對於重複的例子

library(IRanges) ## Bioconductor 
rle = Rle(sample(2, 100000, TRUE)) 
v = successiveViews(rle, rep(5, 1000), gap=10) 

，然後也許

r = seqselect(rle, start(v), end(v)) 
matrix(as.integer(r), nrow=5) 

如果您提供自己的榜樣和時間，然後有可能要問，這是否是一種進步與否。

更新2016年7月29日

的脅迫矩陣可以通過unlist()荷蘭國際集團的意見，並調用矩陣來完成，

matrix(unlist(v), nrow=5) 

這工作，部分原因是matrix()強制將其第一個參數一個向量。