Python的查找和具體情況而定替換/與函數

Question

String = n76a+q80a+l83a+i153a+l203f+r207a+s211a+s215w+f216a+e283l 

我希望腳本來看看一對在時間意義：

評估n76a + q80a。如果abs（76-80）< 10，則用'_'替換'+'：否則不會改變任何內容。 然後評估q80a + l83a，然後做同樣的事情。

所需的輸出應該是：

n76a_q80a_l83a+i153a+l203f_r207a_s211a_s215w_f216a+e283l 

什麼，我試圖，

def aa_dist(x): 
if abs(int(x[1:3]) - int(x[6:8])) < 10: 
    print re.sub(r'\+', '_', x) 

with open(input_file, 'r') as alex: 
    oligos_list = alex.read() 
    aa_dist(oligos_list) 

這是我到這一點。我知道我的代碼只會將'+'全部替換爲'_'，因爲它只評估第一對並替換全部。我應該怎麼做？

Answer 1

import itertools,re 

my_string = "n76a+q80a+l83a+i153a+l203f+r207a+s211a+s215w+f216a+e283l" 
#first extract the numbers  
my_numbers = map(int,re.findall("[0-9]+",my_string)) 
#split the string on + (useless comment) 
parts = my_string.split("+") 

def get_filler((a,b)): 
    '''this method decides on the joiner''' 
    return "_" if abs(a-b) < 10 else '+' 

fillers = map(get_filler,zip(my_numbers,my_numbers[1:])) #figure out what fillers we need 
print "".join(itertools.chain.from_iterable(zip(parts,fillers)))+parts[-1] #it will always skip the last part so gotta add it 

是你可以做到這一點的一種方式......，也是毫無價值的意見

Answer 2

只通過re模塊的示例。

>>> s = 'n76a+q80a+l83a+i153a+l203f+r207a+s211a+s215w+f216a+e283l' 
>>> m = re.findall(r'(?=\b([^+]+\+[^+]+))', s)    # This regex would helps to do a overlapping match. See the demo (https://regex101.com/r/jO6zT2/13) 
>>> m 
['n76a+q80a', 'q80a+l83a', 'l83a+i153a', 'i153a+l203f', 'l203f+r207a', 'r207a+s211a', 's211a+s215w', 's215w+f216a', 'f216a+e283l'] 
>>> l = [] 
>>> for i in m: 
     if abs(int(re.search(r'^\D*(\d+)', i).group(1)) - int(re.search(r'^\D*\d+\D*(\d+)', i).group(1))) < 10: 
      l.append(i.replace('+', '_')) 
     else: 
      l.append(i) 
>>> re.sub(r'([a-z0-9]+)\1', r'\1',''.join(l)) 
'n76a_q80a_l83a+i153a+l203f_r207a_s211a_s215w_f216a+e283l' 

通過定義一個單獨的函數。

import re 
def aa_dist(x): 
    l = [] 
    m = re.findall(r'(?=\b([^+]+\+[^+]+))', x) 
    for i in m: 
     if abs(int(re.search(r'^\D*(\d+)', i).group(1)) - int(re.search(r'^\D*\d+\D*(\d+)', i).group(1))) < 10: 
      l.append(i.replace('+', '_')) 
     else: 
      l.append(i) 
    return re.sub(r'([a-z0-9]+)\1', r'\1',''.join(l)) 

string = 'n76a+q80a+l83a+i153a+l203f+r207a+s211a+s215w+f216a+e283l' 
print aa_dist(string) 

輸出：

n76a_q80a_l83a+i153a+l203f_r207a_s211a_s215w_f216a+e283l