pytables

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我擁有多個組的HDF5文件，其中每個組包含> = 2千5百萬行的數據集。在每一次模擬的時間步驟中，每個代理輸出他/她在那個時間感知的其他代理步驟。在場景中有2000名代理人和數千個時間步驟;輸出的O（n^2）性質解釋了大量的行。我感興趣的是計算獨特的目擊數量。例如，代理商屬於側面，紅色，藍色或綠色。我想創建一個二維表，其中第i行，第j列是類別爲j的代理人數，這些代理人被類別i中的至少一個代理程序

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存儲'object'

PyTables是否支持存儲Python對象？是這樣的： dtype = np.dtype([('Name', '|S2'), ('objValue', object)]) data = np.zeros(3, dtype) file.createArray(box3,'complicated',data) 我在嘗試這樣做的時候當然錯誤... 如何妥善存放對象的數組是否有可能？謝謝

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HDF5：存儲NumPy數據

當我使用NumPy時，我以原生格式* .npy存儲它的數據。它的速度非常快，給了我一些好處，像這樣的我能讀* .npy從C代碼爲簡單的二進制數據（我的意思是* .npy是二進制兼容與C結構）現在我正在處理HDF5（此時PyTables）。正如我在教程中讀到的，他們使用NumPy序列化程序來存儲NumPy數據，所以我可以從簡單的* .npy文件中從C讀取這些數據？ HDF5的numpy是否也

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HDF5內部數據組織和NumPy的使用

爲HDF5文件說，使用NumPy的 HDF5存儲數據「這是建立在HDF5庫，Python語言和NumPy的封裝頂部設有一個面向對象接口，與C擴展的代碼的性能關鍵零部件相結合，使其成爲交互存儲和檢索數據量非常大」 ... 的快速而又非常易於使用的工具「PyTables使用這些NumPy con作爲內存緩衝區，將I/O帶寬推向平臺限制。「那麼這是什麼機制？ PyTables如何使用NumPy？最後

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以存儲的變量名作爲變量名提取PyTables表的最有效方法

以下代碼提供了我需要的功能;但是，對於包含具有64000行的200個變量的表，需要多於10秒的時間。有沒有更有效的方法來創建一個匹配列名稱的變量名稱空間？ strExec = "a = table[:]" for colobj in table.description._f_walk(type="Col"): colName = colobj._v_pathname strE

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hdf查看器在Windows上使用pyTables創建的表格？

viTables只能用於python 2.5。我已經下載HDFView，但是當我嘗試打開我創建以下this tutorial一個表，我得到了以下錯誤消息： Failed to open file C:\tutorial.h5 java.io.IOException: Unsupported fileformat - C:\tutorial.h5 用於獲取HDFView工作任何想法？當我使用

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PyTables問題 - 在迭代表子集時產生不同結果

我是PyTables的新手，我正在使用它來處理從基於代理的建模模擬生成的數據並存儲在HDF5中。我正在使用一個39 MB的測試文件，並且正在經歷一些奇怪的事情。下面是表的佈局： /example/agt_coords (Table(2000000,)) '' description := { "agent": Int32Col(shape=(), dflt=0, pos=0),

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PyTable Column Order

有沒有辦法用特定的列順序創建PyTable？默認情況下，在對createTable（）的調用使用模式定義的字典或類時，字段按字母順序排序。我的需要是建立一個特定的順序，然後使用numpy.genfromtxt（）從文本中讀取和存儲我的數據。不幸的是，我的文本文件沒有包含與文件數據相同的變量名稱。此時，我的字段按字母順序排列，數據未對齊，因此它根據文件佈局排序。並且希望在pyTable中保持相同