read.csv函數read.table與

我在若干案件中看出，雖然read.table()是無法讀取製表符分隔的文件（例如微陣列的註釋表）返回以下錯誤：read.csv函數read.table與

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, : 
line xxx did not have yyy elements

read.csv()完美地在同一個文件中完美無誤地工作。我認爲read.csv()的速度也高於read.table()。

甚至更多：read.table()正在閱讀我的一個文件非常瘋狂。它會在讀取第100行時出現此錯誤，但是當我在同一個文件的頭部之後複製並粘貼第90行到第110行時，它仍會使行100 + 21（在開始時複製新行）出錯。如果該行出現任何問題，爲什麼不在開始時讀取粘貼的行時報告錯誤？我確認read.csv()讀取的文件沒有錯誤。

你知道爲什麼read.table()無法讀取與read.csv()相同的文件嗎？在任何情況下，是否有任何理由使用read.table()？

來源

2012-10-10 Ali

又讀內存使用情況下'read.table（）'的幫助頁面爲什麼它對於大文件可能顯得很慢。 – Chase

我們無法回答您的（更新）問題，但沒有可重複的示例。最常見的讀取問題是（1）未檢測到註釋字符，（2）不匹配的引號，（3）當fill = TRUE時，文件的前5行後每行的字段數發生變化。因爲'read.csv'和'read.table'對'comment'，'quote'和'fill'有不同的默認值，所以這些都可能是問題。 –

PS有8個'comment' /'quote' /'fill'的組合：你可以嘗試所有這些組合，看看結果如何不同 - 這可能會導致你的答案。 'count.fields（）'也可以用於診斷。 –

read.csv圍繞read.table是一個相當薄的包裝;如果您無法通過向read.table提供正確的參數來完全複製read.csv的行爲，我會非常驚訝。但是，其中一些參數（如處理引號或註釋字符的方式）可能會改變函數的速度和行爲。

特別，這是read.csv的全定義：

function (file, header = TRUE, sep = ",", quote = "\"", dec = ".", 
    fill = TRUE, comment.char = "", ...) { 
    read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, 
     dec = dec, fill = fill, comment.char = comment.char, ...) 
}

這樣說，它只是read.table與一組特定的選項。

正如@Chase在下面的評論中指出，爲read.table()幫助頁面說一樣多Details下：

read.csv and read.csv2 are identical to read.table except for the defaults. They are intended for reading ‘comma separated value’ files (‘.csv’) or (read.csv2) the variant used in countries that use a comma as decimal point and a semicolon as field separator.

來源

2012-10-10 21:18:43

好的答案 - 我只是補充說，'read.table（）'的幫助頁面同樣詳細說明了'read.csv和read.csv2與read.table完全相同，除了默認值。它們用於讀取'逗號分隔值'文件（'.csv'）或（read.csv2），該國家使用逗號作爲小數點和分號作爲字段分隔符。所以對於OP來說 - 是的，當你的數據與'read.csv'的默認值不匹配時，你會希望'read.table' – Chase

剛剛更新了問題 – Ali

不要使用read.table閱讀製表符分隔的文件，使用read.delim。（這僅僅是圍繞read.table瘦包裝，但它設置的選項爲適當的值）

來源

2012-10-10 23:00:18 hadley

read_table()做失敗的某個選項卡上的sep「編輯文件和設置sep='\s+'可能有助於假設項目在表中已經沒有空間

來源

2014-06-20 14:26:45 user3760541

read.csv函數read.table與

回答

相關問題