強制qsub（PBS）在退出之前等待作業結束

Question

我一直在使用Sun Grid Engine在集羣的節點上運行我的作業。

通常我會等待作業退出之前完成，我用：

qsub -sync yes perl Script.pl 

但是現在我不使用了Sun Grid Engine的，但PBS Pro的10.4

我不能找到相應的指令來同步。

有人可以幫助我嗎？ 在此先感謝

Answer 1

PBSPro沒有-sync等價的，但您可能能夠使用 -I選項的使用預期來告訴它，以獲得相同的效果運行什麼代碼的結合。

Answer 2

PBS的等效-sync是-Wblock=true。

這可以防止qsub在作業完成之前退出。這可能不常見，但我發現它在使用某些不是爲HPC設計的軟件時非常有用。該軟件執行一個同時運行的工作程序的多個實例。然而，它必須等待一個（或者更多）實例完成，並且在產生下一個結果之前對結果進行一些處理。如果工作程序在沒有寫入特定文件的情況下完成，則認爲其失敗。我能夠爲工作程序編寫一個包裝腳本，編輯爲qsub它，並使用-Wblock=true選項使其等待工作程序作業完成。