[R lme4錯誤 '/ usr/lib中/ rstudio /斌/ rsession'：的malloc（）：內存破壞：

每當我從lme4包運行lmer或glmer，我得到以下錯誤：[R lme4錯誤 '/ usr/lib中/ rstudio /斌/ rsession'：的malloc（）：內存破壞：

Error in '/usr/lib/rstudio/bin/rsession' : malloc(): memory corruption:

我更新了所有的R包，但仍然收到相同的錯誤。任何幫助將不勝感激。由於

sessionInfo（）

R version 3.3.2 (2016-10-31) 
Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit) 
Running under: Ubuntu 16.04.2 LTS 

locale: 
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8  LC_NUMERIC=C    LC_TIME=en_US.UTF-8  
[4] LC_COLLATE=en_US.UTF-8  LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8 
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8  LC_NAME=C     LC_ADDRESS=C    
[10] LC_TELEPHONE=C    LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C  

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

other attached packages: 
[1] lme4_1.1-13 Matrix_1.2-8 

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] minqa_1.2.4  MASS_7.3-45  tools_3.3.2  Rcpp_0.12.9  splines_3.3.2 
[6] nlme_3.1-131 grid_3.3.2  nloptr_1.0.4 lattice_0.20-34

編輯

library(lme4) 
fm1 <- lmer(Reaction ~ Days + (Days | Subject), sleepstudy)

拋出以下錯誤：

Error in '/usr/lib/rstudio/bin/rsession' : malloc(): memory corruption:

來源

2017-02-21 MYaseen208

你可以使用lme4呢？問題是否從終端（rstudio之外）持續存在？ – user20650

是的，我可以加載'lme4'庫，並可以在'RStudio'和'Terminal'中獲得幫助。這個錯誤也出現在'Terminal'中。 – MYaseen208

我會重新安裝Ubuntu終端中的libc軟件包。 –

已經有與最新的矩陣封裝，1.2-8問題報告，對32位操作系統的（私人通信，特里Therneau和布賴恩·裏普利）。一個修復~~可能是在它的途中~~可能需要一段時間（私人通信，M. Maechler），所以我會嘗試降級矩陣到1.2至7版本，例如devtools::install_version("Matrix","1.2-7")（您需要安裝編譯工具）。縱觀NEWS file矩陣，我懷疑這事做：

C-API: SuiteSparse_long is now defined as int64_t on all platforms, and we now include (C99) ‘inttypes.h’

來源

2017-03-08 15:07:57

是的，這有一些東西需要與API的變化，因爲我們（分別爲德克和我，RcppEigen'的'維護者和'Matrix'）（這也需要對事物正確的某些32位平臺！工作）一直沒意識到'RcppEigen'有一個或多或少從Matrix複製粘貼的頭文件...那部分現在已經過時並且發生衝突（至少在32位Windows上）。將2個軟件包更新到最新版本 –

您可以給出推薦的軟件包版本（即，如果您有'Matrix'> = 1.2.8且'RcppEigen'> = 0.3.2.9.1？ –

可能已經與Ubuntu更新的問題。我有同樣的問題，但在Ubuntu基礎的最新更新後，問題得到解決。

來源

2017-03-01 23:17:37 user7644226

感謝@ user7644226爲您的答案。我更新了'Ubuntu'，但是，問題仍然存在。有什麼想法嗎。 – MYaseen208

在問題已經由我（的Matrix維護者）診斷和解決時間：

矩陣1.2-8已經更新了它的API，但RcppEigen已經複製了Matrix的C API（頭文件等）的一部分......並且現在不再兼容......僅在32位上。

與此同時，RcppEigen已更新（和Matrix太）。請安裝這兩個最新版本，所有這些lme4問題已經不復存在了。

來源

2017-04-01 16:15:11

[R lme4錯誤 '/ usr/lib中/ rstudio /斌/ rsession'：的malloc（）：內存破壞：

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