基因繪圖儀安裝錯誤

我在基因繪圖儀（Bioconductor軟件包）安裝過程中。我在Linux Mint的，使用R 2.14 9.我覺得命名空間是負責這一點，但我不知道如何解決它...基因繪圖儀安裝錯誤

這裏的錯誤：

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R") 
> biocLite("geneplotter") 
BioC_mirror: 'http://www.bioconductor.org' 
Using R version 2.14, BiocInstaller version 1.2.0. 
Installing package(s) 'geneplotter' 
Installing package(s) into ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14’ 
(as ‘lib’ is unspecified) 
essai de l'URL 'http://www.bioconductor.org/packages/2.9/bioc/src/contrib/geneplotter_1.31.4.tar.gz' 
Content type 'application/x-gzip' length 1387616 bytes (1.3 Mb) 
URL ouverte 
================================================== 
downloaded 1.3 Mb 

* installing *source* package ‘geneplotter’ ... 
** R 
** data 
** inst 
** preparing package for lazy loading 
** help 
*** installing help indices 
** building package indices ... 
*** tangling vignette sources ... 
    ‘byChroms.Rnw’ 
    ‘visualize.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded 
Error in namespaceExport(ns, exports) : 
    undefined exports: .__C__file, .__C__connection 
Erreur : le chargement a échoué 
Exécution arrêtée 
ERREUR : le chargement a échoué 
* removing ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/geneplotter’ 

The downloaded packages are in 
    ‘/tmp/RtmpO1aY1T/downloaded_packages’ 
Message d'avis : 
In install.packages(pkgs = pkgs, repos = repos, ...) : 
    installation of package ‘geneplotter’ had non-zero exit status

在此先感謝，

來源

2011-11-02 Nicolas Rosewick

聯繫包維護者???在2.14中命名空間處理方式發生了變化，很可能某些Bioconductor軟件包還沒有趕上... –

更新新版本的所有軟件包，特別是rtracklayer;嘗試'biocLite（字符（））' –

我更新了所有的包，但錯誤仍然存在。 –

尋找到這個更加緊密，geneplotterfailed to build的初始版本。所以你選擇的版本是倒數第二個版本。您發現的問題昨天已更正，並在下一個構建週期內及時更正。 geneplotter應該在正確構建時正確安裝，可能在中午PDT;尋找版本1.32.1。回想起來，不是一個SO問題; Bioconductor mailing list有一個post facility，不需要訂閱。

來源

2011-11-02 14:53:31

感謝它現在的作品 –

基因繪圖儀安裝錯誤

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