我在Bioconductor的支持頁上發佈了此消息，但沒有任何答案，因此在此處嘗試。嘗試使用Gviz的IdeogramTrack時出現內部服務器錯誤
我使用R/Biocondutor包，Gviz的IdeogramTrack功能，從我的機構的集羣：
IdeogramTrack(genome="mm10",chromosome="chr1")
當我嘗試這個從主節點，它工作正常，但是當我嘗試這從任何其他節點IO的通過主節點，它掛起它，最終我得到的錯誤消息在集羣中：
Error: Internal Server Error
我能夠通過這些節點訪問enter link description here或任何其他UCSC鏡（使用traceroute http://genome.ucsc.edu），並且可以成功地從其他存儲庫下載數據，例如Ensembl（例如，使用getBM）。
任何想法有什麼不對？
順便說一句，任何想法哪個端口是IdeogramTrack試圖使用？
聽起來你的機構的集羣有問題從UCSC通過Gviz獲取註釋數據。我的一個建議是看你是否可以從UCSC手動下載mm9註釋; here is a good place to start, by chromosome。或者，您可以使用Bioconductor註釋包，例如this。
當你有染色體和染色體信息（例如mapInfo）你data.frame，你可以採取的GenomicRanges::makeGRangesFromDataFrame優勢，以MM9註釋轉換爲GRANGES對象，它可以讓你製作自己的IdeogramTrack對象。有關如何定製IdeogramTrack的詳細信息，請參閱here。
一般來說，這裏是工作流程：
library(GenomicRanges)
library(Gviz)
mm9_annot <- read.table(<file or url with annotation>)
mm9_granges <- makeGRangesFromDataFrame(mm9_annot)
# Alternatively, you may use rtracklayer package
# mm9_granges <- rtracklayer::import(<file or url with annotation>)
my_ideo <- IdeogramTrack(genome="mm9_custom", bands=mm9_granges)
希望這有助於。