計算R中的許多AUC

我對R相當新。我在R中使用ROCR軟件包來計算AUC，我可以對一個預測器做的很好。我期望做的是對100個不同的變量進行許多AUC計算。計算R中的許多AUC

我迄今所做如下：

varlist <- names(mydata)[2:101] 
formlist <- lapply(varlist, function(x) paste0("prediction(",x,"mydata$V1))

但是那麼公式是文本格式，並as.formula是給我的錯誤。任何幫助感謝！提前致謝！

來源

2013-05-13 user2379487

你可以使用一個循環與和保存在一個矢量eacha值。此外，pROC包將更好地爲您的問題！ – Duck 2013-05-13 22:28:22

你的'lapply'裏面的函數看起來就像輸出一個像'prediction（varmydata $ V1）'這樣的語句。我猜你實際上想要*運行*該命令。如果是這樣，你可能需要'lapply（varlist，function（x）prediction（mydata ['x']））''，但是很難說沒有可重現的情況。此外，它看起來像你的代碼有一個缺少的報價。 – nograpes 2013-05-13 22:37:27

感謝您的幫助！你用方括號解決了它（你寫的是我缺少一個報價）。 – user2379487 2013-05-13 23:02:33

lapply中的函數看起來像是輸出一個像prediction(varmydata$V1)這樣的語句。我猜你實際上是想運行那個命令。如果是這樣，你可能想要類似

lapply(varlist,function(x) prediction(mydata[x]))

但是很難說沒有可重現的情況。此外，它看起來像你的代碼有一個缺少的報價。

來源

2013-05-13 23:32:15 nograpes

如果我的理解正確，您希望使用mydata的第一列作爲預測，並將所有其他變量作爲標籤一個接一個地使用。

這是治療mydata的正確方法嗎？這種方式很少見。對於幾種不同的預測（例如迭代交叉驗證，不同分類器的比較），具有相同的真實標籤更爲常見。

然而，要回答你原來的問題：

predictions和labels需要具有相同的形狀ROCR::prediction，例如

無論是作爲基質

prediction (matrix (rep (mydata$V1, 10), 10), mydata [, -1])

或列表：

prediction (mydata [rep (1, ncol (mydata) - 1)], mydata [-1])

來源

2013-05-14 08:14:14 cbeleites

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