2017-09-13 48 views
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圓形FFT卷積我需要的需要在Python

scipy.signal.convolve2d(data, filter, boundary="wrap", mode="same") 

更快的模擬你能不能指點我如何取代它?

P.S. scipy.signal.fftconvolve速度夠快,但它沒有boundary選項,我無法使其在循環卷積模式下工作。

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我認爲沒有邊界選項的原因是因爲FFT不能像那樣工作。而「循環」卷積究竟是什麼意思?編輯:沒關係,我在[Wikipedia](https://en.wikipedia.org/wiki/Circular_convolution)上找到了一個定義。 –

回答

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如果計算如下:

from scipy.fftpack import fft2, ifft2 

f2 = ifft2(fft2(data, shape=data.shape) * fft2(filter, shape=data.shape)).real 

然後f2包含相同的值作爲convolve2d(data, filt, boundary='wrap', mode='same'),但值被移位(「滾動」,在numpy的術語)中的每個軸。 (這是convolution theorem的一個應用程序。)

這裏的一個短函數滾動的結果向得到相同的結果convolve2d函數調用:

def fftconvolve2d(x, y): 
    # This assumes y is "smaller" than x. 
    f2 = ifft2(fft2(x, shape=x.shape) * fft2(y, shape=x.shape)).real 
    f2 = np.roll(f2, (-((y.shape[0] - 1)//2), -((y.shape[1] - 1)//2)), axis=(0, 1)) 
    return f2 

例如,

In [91]: data = np.random.rand(256, 256) 

In [92]: filt = np.random.rand(16, 16) 

In [93]: c2d = convolve2d(data, filt, boundary='wrap', mode='same') 

In [94]: f2 = fftconvolve2d(data, filt) 

驗證結果是否相同:

In [95]: np.allclose(c2d, f2) 
Out[95]: True 

Check性能:

In [96]: %timeit c2d = convolve2d(data, filt, boundary='wrap', mode='same') 
44.9 ms ± 77.3 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each) 

In [97]: %timeit f2 = fftconvolve2d(data, filt) 
5.23 ms ± 11.2 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each) 

的FFT版本更快(但請注意,我選擇的data尺寸是2的冪)。

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謝謝同志!我認爲就是這樣! ^ __ ^ – Felix