當使用vis.gam進行mgcv GAM時，將z軸值歸一化到[0，1]

Question

我剛完成使用mgcv程序包（我將稱這個模型爲gam1.5）來完成擬合GAM。我一直在玩vis.gam函數，我有一個問題，我一直無法解決。

我想標準化我的模型的擬合值，所以當我使用vis.gam時，z軸的限制爲[0，1]。

我的想法就是將正常化公式在我的GAM模型的$fitted.values如下：

gam1.5$fitted.values<-(gam1.5$fitted.values-min(gam1.5$fitted.values))/(max(gam1.5$fitted.values)-min(gam1.5$fitted.values)) 

然而，當我運行vis.gam，它不會改變z軸的規模。我想知道我是否將規範化公式應用於GAM對象內的不正確對象（與$fitted.values不同）。

Answer 1

是的。因爲vis.gam基於predict.gam而您對$fitted.values的更改沒有任何影響！

實際上，您無法通過vis.gam實現目標。此功能僅生成一個繪圖，並且不會爲用戶返回任何內容，以便以後重現該繪圖（除非再次調用vis.gam）。這意味着，我們需要與predict.gam合作。這是基本步驟。

• 設置2D網格/網格。您可能希望使用exclude.too.far過濾遠離訓練數據的數據，以避免可笑的樣條/多項式外推（如vis.gam一樣）;
• 構建一個新的數據框newdat（來自上面的網格）並且調用oo <- predict.gam(gam1.5, newdat, type = "terms")來獲得按照期望的預測。這是一個矩陣。您只需保留與想要繪製的2D平滑相關的列。假設該列存儲在向量z中;
• 增強z填充爲矩陣NA對於那些太遠數據。
• 將z標準化爲[0, 1]。
• 使用image或contour自己生成圖。

理想情況下，我們應該舉一個例子（也許從?vis.gam），並通過上述步驟。然而，你回到我身邊說你很快就用predict.gam來解決問題。然後我不會添加示例。