2015-02-23 68 views
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我有套分數的數據幀,並設置分組變量,類似的:嵌套骨料內,向聚集的多個變量的多個列中的R

s1 s2 s3 g1 g2 g3 
4 3 7 F F T 
6 2 2 T T T 
2 4 9 G G F 
1 3 1 T F G 

我想運行的集合,在我正在做的事情:

aggregate(df[c("s1","s2","s3")],df["g1"],function(x) c(m =mean(x, na.rm=T), sd = sd(x, na.rm=T), n = length(x))) 

我想只有一行代碼,所以我可以一次聚合多個變量。請注意,我並不想通過組合g1-3來獲得s1-3的摘要(按照答案here)。我已經在doBy包中看過summaryBy,但是似乎再次考慮了每個因素的組合,而不僅僅是一個整體,這不是我想要的(雖然有用!)。我一直玩的變種:

apply(df[c("g1","g2","g3")], 2, function (z) aggregate(df[c("s1","s2","s3")],z,function(x) c(m =mean(x, na.rm=T), sd = sd(x, na.rm=T), n = length(x))) 

但我得到的錯誤:'''必須是一個列表「。我想我可以解決如何做到這一點與loop,我知道與各種版本的ddplyreshape你可以得到聚合,但最直觀的方式(對我來說至少)似乎是applyaggregate - 我失去了什麼?

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什麼是理想的輸出? – 2015-02-23 17:14:03

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我真的不介意,我在做一個清單。我喜歡使用數據框,但它似乎將輸出集重新塑造成df實際上是一個單獨的問題 – sjgknight 2015-02-23 17:16:08

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@sjgknight您可以嘗試'lapply(paste0('g',1:3),function(y)aggregate(cbind( s1,s2,s3)〜。,df [c(y,paste0('s',1:3))],function(x)c(mean = mean(x,na.rm = T),sd = sd (x,na.rm = T),n = length(x))))' – akrun 2015-02-23 17:29:00

回答

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讓我們在問題中命名匿名函數,如下所示。那麼,在年底的Map聲明適用於aggregate分別df[1:3]每個分組變量:

mean.sd.n <- function(x) c(m = mean(x, na.rm=T), sd = sd(x, na.rm=T), n = length(x)) 

Map(function(nm) aggregate(df[1:3], df[nm], mean.sd.n), names(df)[4:6]) 

,並提供:

$g1 
    g1  s1.m s1.sd  s1.n  s2.m  s2.sd  s2.n  s3.m  s3.sd  s3.n 
1 F 4.000000  NA 1.000000 3.0000000  NA 1.0000000 7.0000000  NA 1.0000000 
2 G 2.000000  NA 1.000000 4.0000000  NA 1.0000000 9.0000000  NA 1.0000000 
3 T 3.500000 3.535534 2.000000 2.5000000 0.7071068 2.0000000 1.5000000 0.7071068 2.0000000 

$g2 
    g2 s1.m s1.sd s1.n s2.m s2.sd s2.n  s3.m s3.sd  s3.n 
1 F 2.50000 2.12132 2.00000 3  0 2 4.000000 4.242641 2.000000 
2 G 2.00000  NA 1.00000 4 NA 1 9.000000  NA 1.000000 
3 T 6.00000  NA 1.00000 2 NA 1 2.000000  NA 1.000000 

$g3 
    g3  s1.m s1.sd  s1.n  s2.m  s2.sd  s2.n  s3.m s3.sd  s3.n 
1 F 2.000000  NA 1.000000 4.0000000  NA 1.0000000 9.000000  NA 1.000000 
2 G 1.000000  NA 1.000000 3.0000000  NA 1.0000000 1.000000  NA 1.000000 
3 T 5.000000 1.414214 2.000000 2.5000000 0.7071068 2.0000000 4.500000 3.535534 2.000000 

注:這可以稍微用fn$gsubfn package縮短。它允許我們指定所示的代碼,使用公式符號與Map開頭的行匿名函數:

library(gsubfn) 
fn$Map(nm ~ aggregate(df[1:3], df[nm], mean.sd.n), names(df)[4:6])