將兩個矩陣(一個和兩個)匹配在一起並提取匹配矩陣二的索引的快速方法是什麼?矩陣二很大(數百到數千行)。用另一個矩陣對矩陣索引進行子集化
one
[,1] [,2]
9 11
13 2
head(two)
[,1][,2]
[1,] 9 11
[2,] 11 9
[3,] 2 3
[4,] 13 2
[5,] 2 4
[6,] 3 3
輸出應爲(注意指數2怎麼不是一個輸出值),這樣做的
1 4
將兩個矩陣(一個和兩個)匹配在一起並提取匹配矩陣二的索引的快速方法是什麼?矩陣二很大(數百到數千行)。用另一個矩陣對矩陣索引進行子集化
one
[,1] [,2]
9 11
13 2
head(two)
[,1][,2]
[1,] 9 11
[2,] 11 9
[3,] 2 3
[4,] 13 2
[5,] 2 4
[6,] 3 3
輸出應爲(注意指數2怎麼不是一個輸出值),這樣做的
1 4
你可以寫一個C++循環做到這一點相當快
library(Rcpp)
cppFunction('NumericVector matrixIndex(NumericMatrix m1, NumericMatrix m2){
int m1Rows = m1.nrow();
int m2Rows = m2.nrow();
NumericVector out;
for (int i = 0; i < m1Rows; i++){
for (int j = 0; j < m2Rows; j++){
if(m1(i, 0) == m2(j, 0) && m1(i, 1) == m2(j, 1)){
//out[j] = (j+1);
out.push_back(j + 1);
}
}
}
return out;
}')
matrixIndex(m1, m2)
[1] 1 4
雖然我懷疑這會更快先預分配結果向量,東西像
cppFunction('NumericVector matrixIndex(NumericMatrix m1, NumericMatrix m2){
int m1Rows = m1.nrow();
int m2Rows = m2.nrow();
NumericVector out(m2Rows);
for (int i = 0; i < m1Rows; i++){
for (int j = 0; j < m2Rows; j++){
if(m1(i, 0) == m2(j, 0) && m1(i, 1) == m2(j, 1)){
out[j] = (j+1);
//out.push_back(j + 1);
}
}
}
return out;
}')
matrixIndex(m1, m2)
[1] 1 0 0 4 0 0
## 0 == nomatch.
方式一:
a = apply(one, 1, paste0, collapse = "-")
b = apply(two, 1, paste0, collapse = "-")
match(a, b)
#[1] 1 4
我們所有的列粘貼在一起,按行明智的兩個矩陣,然後匹配它們以獲得相同的行。
僅供參考,
a
#[1] "9-11" "13-2"
b
#[1] "9-11" "11-9" "2-3" "13-2" "2-4" "3-3"
你不會說「快」你的意思是計算時間或人的時間。如果只需要進行一次,那麼如果優化人員時間,總體時間可能會最短,並且Ronak的答案將很難被擊敗,這是清晰而強大的。
如果數字都小於某個數字(例如,如您的示例數據中的100),則可以執行類似的操作,但使用算術將兩列組合在一起,然後進行匹配。我懷疑(但沒有測試過),這將比轉換爲字符向量更快。當然,其他算術選項也取決於你的情況。
a <- one[,1]*100 + one[,2]
b <- two[,1]*100 + two[,2]
match(a, b)
我們可以使用%in%
which(do.call(paste, as.data.frame(two)) %in% do.call(paste, as.data.frame(one)))
#[1] 1 4
快速計算機或爲程序員?如果你只需要做一次,那麼成千上萬的行並不是那麼多。 – Aaron
可能的重複https://stackoverflow.com/questions/12463687/subset-a-matrix-by-values-in-the-other-matrix – akrun