igraph

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創建的igraph我有一個類似的問題這一個：Reading adjacency lists with isolated nodes using igraph 我想繪製節點，其中一些沒有關係。但由於某些原因在上面的線程中提到的解決方案是行不通的我的數據 data <- data.frame(ID = c(143918,176206,210749,219170,247818,314764,32145

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如何將igraph拆分爲選擇連接的子圖？

這是問題的一個擴展以前發佈的： How to split an igraph into connected subgraphs? 我會用同樣的例子作爲對前一個問題 library(igraph) g <- simplify( graph.compose( graph.ring(10), graph.star(5, mode = "undirected") ) ) +

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如何在igraph中提取子圖

我想提取該節點周圍的子圖。 library(visNetwork) library(igraph) library(dplyr) g<-data.frame(a=c(LETTERS[1:5], LETTERS[2:6]),b=c(LETTERS[2:6], LETTERS[7:11])) %>% as.matrix %>% graph.edgelist() visIgrap

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的igraph保存情節不輸出文件名作爲一個對象

我跟着的igraph的saving plot文檔工作，但我通過圖列表需要循環，這是行不通的： for (f in flist) { df <- read.table(f, header=TRUE, sep='\t', quote='', comment.char='') png <- paste0(f, '.png') g <- graph_from_data_fra

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使用R查找文本文件中的數據直徑

我有一個由20000行和3列Here you can find a sample from the out1.txt file組成的文件。我試圖導入到R的線，然後找到每20線的直徑（我的意思是將20000線分成1000部分，每部分包含20線），所以首先我需要分別讀取每20條線，然後應用直徑函數在R. 之後，我需要讀取每個部分作爲圖形，然後找到直徑。包含20000行的文件的名稱是（out1.txt

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基於邊權重的子集圖

我有一個圖G =（V，E），其中有幾個屬性，包括邊權重屬性。我試圖根據權重高於x的條件創建子圖。我試過了標準R子集選項g <- E(g)[weight > max(weight)*.10]，但我總是得到一個向量。我不知道我在做什麼錯在這裏。

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在Mac OSX中安裝python-igraph Sierra

我在我的Mac中安裝了anaconda。我正在嘗試安裝python-igraph。我嘗試下面的命令來安裝它： $ brew install igraph $ pip install python-igraph 我的蟒蛇設置： Python 2.7.13 |Anaconda custom (x86_64)| (default, Dec 20 2016, 23:05:08) [GCC 4.2

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如何在不使用data.frames的情況下合併兩個igraphs對象？

比方說，我有兩個圖：net1和net2具有相同的節點名稱。我想聯合net1和net2成一個圖形net然後從節點A添加一個新的邊緣到節點A其中從部件net1第一節點A和從組件net2第二節點A。我曾嘗試： library(igraph) net1 <- graph_from_literal(A-B-C) net2 <- graph_from_literal(A-B-C) par(mfrow=c

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支持igraph中稀疏網絡

我正在處理一個稀疏數據網絡集，數據集中的頂點ID可以保存一個值，任何地方在1-4000範圍內，例如一小部分數據可能包含頂點值 2,300,400,700,3000，...... 對我來說，如果Igraph庫只接受稀疏數據集或期望值的範圍，我還不清楚？我是否已經重新確定/重新映射我的數據集成連續的數據範圍之前我調用任何IGRAPH功能例如重新映射的數據值作爲每 2變爲1 300變爲2 400變成

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查找igraph頂點的第n級鄰居

我有一個很大的igraph對象。對於給定頂點的有向圖，我有興趣列出節點距離初始節點的距離小於d。例如，如果我正在從V0開始的3個步驟內查找頂點，函數將返回一個數據框，其中第一列包含與初始頂點的距離，第二列包含頂點的名稱。 level, vertex.name 0, V0 1, V23 1, V45 ... 2, V12 ... 3,V730 我嘗試使用功能的igraph的nei