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我想在Fortran中使用HDF5 Tables,但我遇到了一些麻煩。一個例子會很有用,但只有C例子是provided。如何在Fortran中使用HDF5表
我的問題的一部分是如何處理它需要的偏移量和大小。使用gfortran,我可以使用sizeof和loc,但這些都是特定的擴展名。我發現Fortran的新版本有c_loc和c_sizeof可能會有所幫助,但也許它們只適用於c變量?
我也不知道chunk_size應該是什麼。
FWIW,下面的醜陋代碼使用loc和sizeof。它可以編譯和運行,但給出了一個錯誤(並且不會把任何東西在HDF5文件):
size: 8
offsets: 0 4
types: 0 0
initialized
file open
HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.8.8) thread 140636908803840:
#000: ../../../src/H5Tcompound.c line 370 in H5Tinsert(): not a datatype
major: Invalid arguments to routine
minor: Inappropriate type
table created
因此偏移可能是有意義的,但類型不會真的。
任何幫助,將不勝感激。謝謝。
module tdef
type blarg
integer :: arg
real :: blah
end type
end
PROGRAM H5_TABLE
use tdef
USE HDF5
use h5lt
use h5tb
IMPLICIT NONE
INTEGER(HID_T) :: file_id
INTEGER :: error
integer(HSIZE_T) :: nfields, nrecords
integer(SIZE_T) :: type_size
type(blarg) :: test
character(len=4), dimension(2) :: field_names = (/' arg', 'blah'/)
integer(SIZE_T), dimension(2) :: field_offset
integer(HID_T), dimension(2) :: field_types
integer(HSIZE_T) :: chunk_size = 1
integer :: compress = 0
nfields = 2
nrecords = 2
type_size = sizeof(test)
print *, "size:", type_size
field_offset(1) = loc(test%arg) - loc(test)
field_offset(2) = loc(test%blah) - loc(test)
print *, "offsets:", field_offset
field_types(1) = H5T_NATIVE_INTEGER
field_types(2) = H5T_NATIVE_REAL
print *, "types:", field_types
CALL h5open_f(error)
print *, "initialized"
CALL h5fcreate_f("cpt.h5", H5F_ACC_TRUNC_F, file_id, error)
print *, "file open"
call h5tbmake_table_f('Table Title', file_id, "Steps", nfields, &
nrecords, type_size, field_names, field_offset, &
field_types, chunk_size, compress, error)
print *, "table created"
CALL h5fclose_f(file_id, error)
CALL h5close_f(error)
END PROGRAM H5_TABLE
補償看起來不錯。 'C_loc'不會幫助你,因爲它返回'type(c_ptr)',你不能對它進行指針運算(沒有額外的'transfer')。我玩過你的程序,但我不知道HDF5足以發現問題。 –
感謝您的關注。您對c_loc的評論有助於爲我清除[this](http://coding.derkeiler.com/Archive/Fortran/comp.lang.fortran/2009-01/msg00104.html);現在我明白爲什麼作者使用轉移。 – lnmaurer