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我使用以下shell腳本在集羣上運行模擬。變量未在shell腳本中識別
#PBS -N 0.05_0.05_m_1_200k
#PBS -l nodes=1:ppn=1,pmem=1000mb
#PBS -S /bin/bash
#$ -m n
#$ -j oe
FOLDER= 0.57
WDIR=/home/vikas/ala_1_free_energy/membrane_200k/restraint_decoupling_pullinit_$FOLDER
cd /home/vikas/ala_1_free_energy/membrane_200k/restraint_decoupling_pullinit_$FOLDER
LAMBDA= 0.05
/home/durba/gmx455/bin/mdrun -np 1 -deffnm md0.05 -v
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現在我的問題是,我的腳本不能識別變量文件夾,並拋出一個錯誤
couldn't find md0.05.tpr
其存在的文件夾中。如果我在$文件夾的位置寫入0.57,它工作正常,這讓我覺得它不能識別變量FOLDER。 LAMBDA在這兩種情況下都是完美的認可。如果有人能幫助我,我會很感激。
它的工作表示感謝。 –