調用從MPI進程調用MPI進程的腳本

Question

我有一個MPI程序（Fortran，MPICH），我需要將其從shell腳本中提取出來，該腳本依次啓動自己的MPI程序（使用mpirun）。到目前爲止，我已經將shell（system）命令包裝在if(system_num .eq. root_system_num)事件中，所以只有一個MPI進程運行腳本。但是，這會導致一系列HYDU_create_process錯誤。

我認爲使用MPI_Comm_spawn但也有像「MPI不說，如果你啓動的程序是一個shell腳本和shell腳本啓動調用MPI_INIT程序會發生什麼」，所以這似乎不太理想，以及警告。

幾點：

• 稱爲shell腳本並不需要在所有調用程序進行交互的程序。調用程序只需等待該過程完成即可。
• 將shell腳本轉換爲單獨的可執行文件（很多環境變量設置，等等）並不容易。
• 理想情況下，這應該適用於MPICH和Open MPI。

有沒有辦法做到這一點？

Answer 1

對於MPICH，不幸的是，您最好使用MPI_Comm_spawn。你唯一的選擇是在調用嵌套的MPI程序之前，找出所有依賴於實現的依賴於版本的環境變量，這些變量在shell腳本中需要爲unset。 （對於MPICH）一些示例變量將包括PMI_RANK和PMI_PORT：

% mpiexec -n 1 env | egrep '^PMI|^HYD' 
HYDI_CONTROL_FD=8 
PMI_RANK=0 
PMI_FD=7 
PMI_SIZE=1 

顯然，不同的變量將需要重組後開放MPI或不同版本MPICH2/MPICH的。