如何在編寫包時指定依賴關係？

我想寫一個包含一些依賴關係的包。我能夠使用library()手動加載依賴關係，但我希望它們能夠與我的包一起自動加載。我認爲DESCRIPTION文件上的屬性Imports可以用於這項工作，但它不適用於我。如何在編寫包時指定依賴關係？

所以我從頭開始一個完全新的會話：

sessionInfo() 

R version 3.3.0 (2016-05-03) 
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit) 
Running under: OS X 10.11.4 (El Capitan) 

locale: 
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8 

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] tools_3.3.0

然後我打開我的包，進口

Imports: 
dplyr, 
zipcode, 
readxl, 
mosaic

事實上再次尋找到我的會議中，依賴我指定mypackage_0.1.0正確加載：

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

other attached packages: 
[1] mypackage_0.1.0 

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] Rcpp_0.12.4  nloptr_1.0.4  plyr_1.8.3   tools_3.3.0  mosaic_0.13.0  testthat_1.0.2  digest_0.6.9  
[8] lme4_1.1-12  zipcode_1.0  memoise_1.0.0  gtable_0.2.0  nlme_3.1-127  lattice_0.20-33 mgcv_1.8-12  
[15] Matrix_1.2-6  DBI_0.4-1   parallel_3.3.0  SparseM_1.7  ggdendro_0.1-20 gridExtra_2.2.1 withr_1.0.1  
[22] dplyr_0.4.3  stringr_1.0.0  roxygen2_5.0.1  MatrixModels_0.4-1 devtools_1.11.1 grid_3.3.0   nnet_7.3-12  
[29] R6_2.1.2   readxl_0.1.1  mosaicData_0.13.0 minqa_1.2.4  reshape2_1.4.1  ggplot2_2.1.0  car_2.1-2   
[36] magrittr_1.5  scales_0.4.0  splines_3.3.0  MASS_7.3-45  assertthat_0.1  pbkrtest_0.4-6  colorspace_1.2-6 
[43] quantreg_5.21  stringi_1.0-1  munsell_0.4.3  crayon_1.3.1

但是，無論何時我編寫了一個函數嵌套來自任何「通過命名空間加載」包的其他函數，我得到一個錯誤。例如：

f <- function(x) {tbl_df(x)}  
> f(cars) 
Error in f(cars) : could not find function "tbl_df"

我認爲問題是來自依賴關係的函數只能在我正在編寫的包的其他函數中使用。但是，當我將f()定義爲我的包的新功能時，我得到了同樣的錯誤。

我建議仔細檢查NAMESPACE文件是否已保存並重新加載。

這是我的NAMESPACE文件，具有f()函數。

# Generated by roxygen2: do not edit by hand 

export(chain_spreadsheet) 
export(f) 
export(mapping) 
export(stalary)

但是，即使在重新生成文檔並重新加載軟件包後，我仍然有同樣的問題。

來源

2016-05-17 Dambo

你是否更新過NAMESPACE文件？ – cdeterman

對不起，我再次檢查。是的，我更新了NAMESPACE。還是行不通。 – Dambo

您是指您正在展示的功能還是您的包裝內？一旦你更新了NAMESPACE，你需要重新編譯/重新安裝軟件包，它應該可以工作。如果這仍然是個問題，您應該向NAMESPACE添加問題。 – cdeterman

您還需要在NAMESPACE文件中有import語句。爲了自動完成roxygen2，您需要使用@import方法。

例如，在任何.R文件

foo.R

#' @import dplyr 

# my other code 
...

現在，當你與roxygen2重建命名空間將自動更新。這就是爲什麼它規定「不要手工編輯」，因爲roxygen2應該處理所有這些。你只需要使用必要的功能。

來源

2016-05-18 12:36:43 cdeterman

我道歉，它部分工作，但我不知道爲什麼它找不到函數'readxl :: excel_sheehts'。當我調用'sessionInfo（）'時，'readxl'包含在'loeaded via namespace'庫中，但顯然R沒有看到它。不過，我有另一個基於'dplyr'的函數，它按照你說的方式加載，並且工作得很好。 – Dambo

@Dambo是'excel_sheehts'的拼寫錯誤嗎？確保你有'@import readxl'，並且NAMESPACE在重建後都有。 – cdeterman

對不起，這是我的錯字。是的，它有兩個，我可以看到他們都運行'sessionInfo（）'（但在「通過命名空間加載」，而不是在「附加」）。順便說一句，如果我不得不在每個函數中使用'@import'，我仍然沒有明確說明在描述文件中導入庫的目的。稍後我將使用'dplyr'和'readxl'兩個函數創建一個新的包，以提供更加可靠的問題複製。謝謝。 – Dambo

如何在編寫包時指定依賴關係？

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