使用cython擴展打包python

Question

我試圖構建一個使用python和cython模塊的包。在構建和安裝之後，我遇到了導入問題，我不確定如何從構建過程生成的.so文件中導入文件。

之前建設我的文件夾結構看起來像這樣

root/ 
├── c_integrate.c 
├── c_integrate.pyx 
├── cython_builder.py 
├── __init__.py 
├── integrator_class.py 
├── integrator_modules 
│   ├── cython_integrator.py 
│   ├── __init__.py 
│   ├── integrator.py 
│   ├── numba_integrator.py 
│   ├── numpy_integrator.py 
│   ├── quadratic_error.png 
│   ├── report3.txt 
│   ├── report4.txt 
│   └── report5.txt 
├── report6.txt 
├── setup.py 
└── test 
    ├── __init__.py 
    └── test_integrator.py 

樓內有python3.5 setup.py build給出root

root/build/ 
├── lib.linux-x86_64-3.5 
│   ├── c_integrate.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so 
│   ├── integrator_modules 
│   │   ├── cython_integrator.py 
│   │   ├── __init__.py 
│   │   ├── integrator.py 
│   │   ├── numba_integrator.py 
│   │   └── numpy_integrator.py 
│   └── test 
│    ├── __init__.py 
│    └── test_integrator.py 

這個新的文件夾中的setup.py文件看起來像這樣

from setuptools import setup, Extension, find_packages 
import numpy 

setup(
    name = "integrator_package", 
    author = "foo", 
    packages = find_packages(), 
    ext_modules = [Extension("c_integrate", ["c_integrate.c"])], 
    include_dirs=[numpy.get_include()], 
) 

我的問題那麼：怎麼做我將.so文件中的函數的輸入語句寫入位於build目錄中的root和cython_integrator和test_integrator中的ìntegrator_class.py。追加到sys.path似乎是一個我不太喜歡的快速和骯髒的解決方案。

編輯： 正如在評論中指出，我還沒有安裝軟件包。這是因爲我不知道寫什麼從.so文件

Answer 1

導入在沒有特定的順序：

1. 文件setup.py通常低於的根源所在項目。例如：

   library_name/ 
       __init__.py 
       file1.py 
   setup.py 
   README 
   

2. 然後，構建目錄一起出現在項目源代碼，而不是在項目源。

3. 要在Python中導入文件c_integrate.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so，只需導入「c_integrate」即可。其餘的命名自動處理，因爲它只是平臺信息。見PEP 3149

4. 有效模塊的

   1. 與modulename/__init__.py文件的目錄一個
   2. 名爲modulename.py
   3. 文件名爲modulename.PLATFORMINFO.so
   當然

   位於文件Python路徑。因此，編譯的Cython模塊不需要__init__.py文件。

   您的具體情況，將用Cython代碼在項目目錄，要麼使用相對導入import .c_integrate或完整from integrator_modules import c_integrate在當你的包是安裝後者只適用。

少數的這些信息都可以在我的博客文章上用Cython模塊http://pdebuyl.be/blog/2017/cython-module.html

我認爲，這應該讓你建立一個適當的包裝，如果沒有下面評論被發現。

編輯：完成配置（見下文評論），海報也

1. 固定在setup.py文件模塊路徑，以便它是完整的模塊名稱從PYTHONPATH開始：Extension("integrator_package.integrator_modules.c_integrat‌​or", ["integrator_package/integrator_modules/c_integrator.c"]代替的Extension("c_integrate", ["c_integrate.c"])]
2. Cythonize模塊，構建它並使用相同的Python解釋器。

更多評論：setup.py文件也可以對文件進行cython化。作爲源包括.pyx文件而不是.c文件。

cythonize(Extension('integrator_package.integrator_modules.c_integrat‌​or', 
      ["integrator_package/integrator_modules/c_integrator.pyx"], 
      include_dirs=[numpy.get_include()]))