使用doMPI寫入日誌文件

Question

我在HPC上運行doMPI，我想記錄來自工人的輸出。使用doParallel，我可以使用makeCluster(outfile='myfile.log')。使用doMPI，在任何方法中似乎都不存在任何參數。我嘗試使用sinkWorkerOutput()。這是有效的，但只爲其中一名工作人員寫了日誌。我懷疑每個工人都在重寫另一個工人。 outfile doMPI有模擬嗎？

一個相關的問題 - 在一個工人內部，我能找到工人編號嗎？

編輯：這是一個答案的鏈接討論如何使用OUTFILE：在doMPI包How can I print when using %dopar%

感謝你的幫助，

本

Answer 1

爲了工人的產量發送到一個文件，設置startMPIcluster 「詳細」 選項TRUE：

cl <- startMPIcluster(verbose=TRUE) 

這將創建一個文件p呃名字爲「MPI_1_steve_41747.log」的工人。 MPI等級，用戶名和進程ID用於使文件名唯一。您也可以通過「logdir」選項指定日誌目錄。

要獲得工人編號，您可以簡單地調用mpi.comm.rank函數。