通過XGrid運行BLAST

Question

有沒有人有使用XGrid運行BLAST的經驗？

谷歌搜索顯示一個名爲'Xgrid BLAST'的工具存在，但沒有獲得。

Answer 1

BLAST包含在Xgrid中。從「Utilization of a Local Grid of Mac OS X-Based Computers using Xgrid」引用：

的Xgrid包括一個強大的， 定製的，通用的工作 提交基於的Xgrid技術 運行的情況下，界面的Xgrid BLAST， 一個功能齊全，支持網格的 應用NCBI BLAST 局部比對搜索算法工具。

安裝Xgrid後，您可以在任何客戶端計算機上打開/Applications/Xgrid BLAST.app。

欲瞭解更多信息，請參見：

• 的Xgrid installation documentation由猶他大學。
• How to use Apple's xgrid for running BLAST jobs由NACS研究計算支持組
• Xgrid basics由Blaxter實驗室在愛丁堡大學進化生物學研究所。它包含一個樣本Perl file，用於將BLAST作業提交給Xgrid。

最後的技巧，如果你有相關的對未來問題的任何生物信息學，還有對生物信息學家專門針對出現StackOverflow克隆叫BioStars。你可能會在那裏得到更快的答案。