RStudio中的R編碼器：無法設置根目錄結構的選項

使用RStudio中的編織按鈕對我來說工作起來非常漂亮，可以處理簡單文件，自動生成Rmd文件，然後生成PDF。現在我工作的一個大項目，我已經分裂目錄RStudio中的R編碼器：無法設置根目錄結構的選項

MainProjectDir/

MainProjectDir /代碼/

MainProjectDir/DataRaw/

MainProjectDir/DataWork/

getwd（）爲我提供MainProjectDir路徑。 Code目錄中的.r文件相互調用，並通過使用MainProjectDir路徑中的相對路徑來加載和保存數據目錄中的數據。

現在，使用針織按鈕的代碼目錄.R文件，當我得到連接錯誤：

錯誤的文件（文件名，「R」，編碼=編碼）：無法打開連接

這裏閱讀答覆少看一輝的頁面之後，我嘗試設置在knitr包root.dir選項與

knitr :: opts_knit $組（root.dir =「..」）

在按下RStudio中的編織按鈕之前在控制檯中。我仍然有同樣的錯誤。也嘗試了路徑的絕對路徑版本。我究竟做錯了什麼？

2016-08-23 claudiu

您是否嘗試過使用'rmarkdown :: render'函數？ – YCR

我正在使用File/Knit菜單命令，讓RStudio對pandoc/knitr執行調用。適用於簡單的目錄結構，這就是爲什麼我試圖找到一種方法來正確描述相對路徑。你建議的流程是什麼？ – claudiu

你有另一個腳本，你在其中使用函數rmarkdown :: render。它可以更好地控制你的環境。最好是用rm（list = ls（））'來清理你的全球環境。 – YCR

找到此解決辦法在github討論線程中的問題，添加至R代碼和作品：

如果（基名（getwd（））== 「代碼」）setwd（normalizePath（「..」））

張貼這爲尋找一個快速的解決方案，但如果有人能解釋什麼是錯的

knitr :: opts_knit $組（root.dir =「..」）

以及如何修復它請發佈，我會接受他的答案。

2016-08-23 14:05:26 claudiu

不知道這是否能解決你所有的麻煩，但是你有沒有看過Dean Attali的ezknitr包？它給你更多的目錄靈活性。

2016-08-23 19:31:51

現在看，它基於該文件包應該確實允許我使用的目錄結構。不過，現在我想保留使用RStudio針織按鈕和原始R文件而不是Rmd的便利性，以便保持找到醜陋的解決方法。請參閱我寫給Gregor上面的建議的評論。如果我只能刪除setwd（）... – claudiu

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