在Trimmomatic中，滑動窗口是否有任何默認值？

Question

如果我給AVGQUAL命令：20沒有滑動窗口它會設置滑動窗口的任何默認值？

Answer 1

如果您檢查trimmmomatic網站http://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomatic，你會在那裏找到手冊。

在它說爲AVGQUAL該手冊：AVGQUAL: Drop the read if the average quality is below the specified level

因此，需要沒有窗口，因爲這步驟總結了所有品質，是否達到閾值由長度和檢查劃分或不是，再滴或保留讀。