如何抑制rpy2中的錯誤消息

Question

以下代碼不起作用。看來R警告消息引發了python錯誤。

# enable use of python objects in rpy2 
import rpy2.robjects.numpy2ri 
import numpy as np 
from rpy2.robjects import r 

# create an example array 
a = np.array([[5,2,5],[3,7,8]]) 

# this line leads to a warning message, which in turn raises an 
# error message if run within a script. 
result = r['chisq.test'](a) 

運行上面的示例代碼中IPython的作品，但是，它運行一個腳本，裏面提出了一個errorTypeError：「模塊」對象是unsubscriptable。我認爲這是由於警告信息。

避免此問題的最佳方法是什麼？ 在此先感謝！

Answer 1

把打印語句錯誤前右：

print(r) 
result = r['chisq.test'](a) 

錯誤消息TypeError: 'module' object is unsubscriptable聲稱，r被引用的模塊。當您運行與打印語句的腳本，你將看到類似

<module 'rpy2' from '/usr/lib/python2.6/dist-packages/rpy2/__init__.pyc'> 
Traceback (most recent call last): 
    File "/home/unutbu/pybin/test.py", line 14, in <module> 
    result = r['chisq.test'](a) 
TypeError: 'module' object is unsubscriptable 

注意，第一行說，r被引用模塊rpy2。 這應該給你一個線索，看看哪裏出了問題。一旦找到故障排除模塊的名稱，請檢查您的導入語句，以瞭解r如何重新分配給該模塊。

舉例來說，如果你有

from rpy2.robjects import r 
... 
import rpy2 as r 

那麼第二個導入語句覆蓋第一，並且名稱r此後引用模塊rpy2而不是rpy2.robjects.r。