在Cygwin上安裝HDF5庫：「make check」停留在testswmr.sh，沒有錯誤信息

我目前正在Cygwin上安裝HDF5庫，更確切地說是hdf5-1.10.0-patch1，因爲我想使用它與Fortran。繼從hdfgroup網站（here is the link）的說明，我做了以下內容：在Cygwin上安裝HDF5庫：「make check」停留在testswmr.sh，沒有錯誤信息

./configure --enable-fortran 
make > "out1_check.txt" 2> "warn1_check.txt" & 
make check > "out2_check.txt" 2> "warn2_check.txt" &

最後一個命令（make check）的執行過程，因爲它應該，直到它被卡住。此過程不會停止，事情正在發生（8-12％的CPU是由sh.exe使用，已經39小時的CPU時間），但「out2_check.txt」看起來像

Making check in src 
... 
[many successful checks] 
... 
============================ 
No need to test testlinks_env.sh again. 
============================ 
============================ 
Testing testswmr.sh

不幸的是，我不知道有第一次運行make check的輸出文件，但它沒有包含有關Testing testswmr.sh的更多信息。從來沒有任何錯誤消息。

那麼，這是什麼testswmr.sh，它爲什麼會卡住，我如何最終確定安裝過程？也許我可以跳過剩下的支票，然後前往make install？

重要說明：舊版HDF5已經從Cygwin回購庫安裝。但它似乎並不支持Fortran，所以我決定自己安裝最新版本。

可用（和使用）編譯器是gcc和gfortran。

來源

2017-04-06 Pankrat

你嘗試在'testswmr.sh'看看，找出它做什麼？（你應該） –

好吧，我看了看，但我並不真正瞭解詳細情況。它由幾個測試組成，如「##編寫器測試 - 測試擴展數據集」，「##刪除測試 - 測試縮小數據集」，「##稀疏編寫器測試 - 測試寫入數據集中的隨機位置」，等 – Pankrat

據我所知，Windows上只支持Intel Fortran。這裏沒有Cygwin下載https://support.hdfgroup.org/HDF5/release/obtain518.html，我從來沒有遇到Cygwin/Fortran/HDF5的經驗報告。

您的選擇：

使用英特爾Fortran
使用Linux或Mac

對不起

來源

2017-04-06 16:34:48

感謝您的回答，@Pierre！當我看到Cygwin-repo hdf5軟件包僅包含C時，我還認爲Cygwin Fortran HDF5不支持。但是，基於[本說明文件]（https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/current/） src/unpacked/release_docs/INSTALL_Cygwin.txt），我在上面的問題中提到過，可以使用hdf5的Unix源代碼並在Cygwin中手動安裝它（並且明確提到可以使用'--enable - fortran'標誌）。這正是我想要做的。 – Pankrat

好吧，我現在檢查鏈接指令:-)這仍然是一個幾乎沒有使用的組合，但SWMR功能（單個作家多讀者）依賴於文件系統，可能無法在FAT磁盤上工作。我在內存中沒有引用，但你應該檢查SWMR兼容性。如果它不被支持，沒有問題的測試失敗，但你不應該使用該功能。 –

謝謝，@PierredeBuyl！現在我不需要SWMR，但是我已經成功安裝了庫。使用$ LD_LIBRARY_PATH，$ LIBRARY_PATH和include標誌的正確值，代碼編譯和輸出完全正確。我解決它的方式：卸載所有內容，重新啓動，再次使用「make check> output_check.dat」，「make install」;）安裝它可能是防病毒或過期的Windows更新，它會停止以前的安裝。但是，如果添加一個註釋，說明仍然可以使用Unix源代碼在Cygwin下爲Fortran安裝HDF5，我可以接受您的答案 – Pankrat

在Cygwin上安裝HDF5庫：「make check」停留在testswmr.sh，沒有錯誤信息

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