密度曲線上plotly直方圖

我使用plotly繪製一個數據集的直方圖我與密度曲線上plotly直方圖

test <- data.frame(y = rgamma(1000, shape = 0.25, rate = 0.0054)) 
plot_ly(x = ~test$y, type = "histogram", nbinsx = "23")

情節本身是好的，但我不清楚如何繪製流過一個光滑的密度曲線工作直方圖的輪廓。

Plotly reference manual表明，

直方圖跡被初始化plot_ly或add_trace：

plot_ly(df, type="histogram"[, ...]) 
add_trace(p, type="histogram"[, ...])

和有我假設將允許用戶繪製的密度曲線histnorm (enumerated: "" | "percent" | "probability" | "density" | "probability density") histonorm功能，但我不知道如何使用這個功能。

有興趣瞭解別人如何解決這個問題。任何提示或建議非常感謝。

來源

2016-12-28 missy morrow

我不知道如果一個方法可能是'scale'密度，使其上的情節更加清晰。 'test = data.frame（y = rgamma（1000，shape = 0.25，rate = 0.0054））; fit = density（test $ y）; scale = 500/max（fit $ y）; plot_ly（）％>％add_histogram（x =〜test $ y，name =「直方圖」）％>％add_lines（x = fit x，y = scale * fit $ y，name =「Density」）' –

@DarshanBaral這很有趣 –

一個選項，如果你比gigplot的API更熟悉，那麼最簡單的方法就是先用ggplot2創建圖。

library(plotly) 
library(ggplot2 
test <- data.frame(y = rgamma(1000, shape = 0.25, rate = 0.0054)) 

p <- ggplot(test, aes(x = y, y = ..density..)) + 
    geom_histogram(fill = "steelblue", bins = 23) + 
    geom_density() 

ggplotly(p)

來源

2016-12-28 21:14:17

我試過ggplot，但我無法抑制密度圖產生的y軸值，並顯示直方圖的頻率計數。 –

雖然不理想 - 這裏的做到這一點的方法之一。

編輯：更新的y軸限制

library(plotly) 

y <- rgamma(1000, shape = 0.25, rate = 0.0054) 
dens <- data.frame(x = density(y)$x, 
        y = density(y)$y) 

miny <- 0 
maxy <- max(dens$y) 

plot_ly() %>% 
    add_histogram(x = y) %>% 
    add_lines(data = dens, x = ~x, y = ~y, yaxis = "y2", 
      line = list(width = 3)) %>% 
    layout(yaxis2 = list(overlaying = "y", 
         side = "right", 
         range = c(miny, maxy), 
         showgrid = F, 
         zeroline = F))

來源

2016-12-28 21:49:28 royr2

x軸上有一條額外的線可能是由於密度圖 –

密度曲線上plotly直方圖

回答

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