如何使用knitr來比較不同版本R的性能？

Question

我要評估的不同版本R的一些代碼的性能這在原則上很容易：

• 開始[R
• 使用system.time()來衡量它需要運行一段代碼
時間
• 終止[R
• 沖洗，並在不同的版本

現在，我想用knitr創建報告要做到這一點重複。所以，在我看來，我需要一種機制在每個塊中開始新的會話。

我該怎麼做？

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一些樣品knitr降價代碼作爲示範。此代碼使用ggplot繪製圖形，但顯然兩個版本都返回相同的計時，因爲我不知道如何爲每個塊啓動新版本的R。

Comparison of R performance 
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# Do analysis in R version 2.14 

```{r fig.width=6, fig.height=3} 
library(ggplot2) 
data(diamonds) 

system.time({ 
    p <- ggplot(diamonds, aes(carat, price/carat, colour=clarity)) + geom_point() 
    print(p) 
}) 
``` 


# Repeat same analysis in R 2.15 

```{r fig.width=6, fig.height=3} 
library(ggplot2) 
data(diamonds) 

system.time({ 
    p <- ggplot(diamonds, aes(carat, price/carat, colour=clarity)) + geom_point() 
    print(p) 
}) 
``` 

Answer 1

添加Rscript發動機knitrwas easy，但我被an R bug忍住。無論如何，這款引擎自version 1.1.5起可用，並且將作爲版本1.2在CRAN上。

現在，您可以指定塊選項engine='Rscript'和engine.path='path/to/the/desired/Rscript'。

對於大型的性能比較，我覺得阿里B.弗裏德曼建議在上面的註釋是一個更好的方式去。如果您有許多代碼塊進行比較，那麼鍵入引擎路徑將非常繁瑣。