如何獲取NIfTi對象中的圖像數量？ （nibabel）

Question

我有一個從dicom文件目錄生成的Nifti對象。 看來，Nifti應該知道它擁有多少幀，但我可以在標題信息中找到的就是形狀。問題是，形狀有時（num_images，x，y）和有時（x，y，num_images）。

我發現唯一的nibabel函數與Ecat庫相關。我不熟悉ecat格式，但我想讓我的方法適用於任何nii文件。我正在與nibabel圖書館合作。

有沒有辦法檢索NIFTI文件中的圖像數量？

Answer 1

我猜你在看fMRI，DTI或ASL數據。

假設你的4D nii堆棧被稱爲'data.nii'。

剛進入該目錄，並做到：

mri = nib.load('data.nii')

mri.shape

你看到的第四個元素將是卷數。你可以這樣訪問它：mri.shape[3]如果你需要它在某種程度上用於你的程序。

這對我一直工作。如果你的數據以不一致的方向「疊加」，你將不得不變得幻想。

您可以包含基於圖像維度的檢查。例如，如果您知道您的圖像是128x128x128，那麼您可以繼續並獲取mri.shape不是128的任何一個元素，但是由於幾個原因，此方法並不理想。