在Dockerfile中添加用於從Github安裝的R軟件包

如何在我的Dockerfile中使用github添加R軟件包的安裝指令。在Dockerfile中添加用於從Github安裝的R軟件包

R中的環境通常的命令是：

devtools::install_github("smach/rmiscutils")

但沒有成功爲止。試圖GitHub庫添加到安裝說明：

RUN install2.r --error \ 
    -r 'http://cran.rstudio.com' \ 
    -r 'http://github.com/smach/rmiscutils'

但我得到一個錯誤：

error in download. Status was '404 Not found'

也許用香草[R通話，但找不出命令。任何提示？

2017-04-01 Forge

您是否使用從泊塢樞紐正式R圖像時，這裏添加的命令？ https://hub.docker.com/_/r-base/ – thaJeztah

rocker/rstudio基於r服務器 – Forge

試試這個：

RUN installGithub.r smach/rmiscutils \ 
&& rm -rf /tmp/downloaded_packages/

一個好的做法是去除所有下載的軟件包，以縮小圖像尺寸。

安裝從Bioconductor的（萬一有人在這裏結束尋找幫助）

RUN install2.r -r http://bioconductor.org/packages/3.0/bioc --deps TRUE \ 
    phyloseq \ 
    && rm -rf /tmp/downloaded_packages/

2017-04-04 18:53:10 useRj

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