strsplit（x，split =「」）中的錯誤：非字符參數

我試圖在r中使用protr包，但當我嘗試從序列中提取氨基酸組成時出現以下錯誤：strsplit（x，split =「」）中的錯誤：非字符參數

require(protr) 
x = readFASTA(system.file('protseq/P00750.fasta', package='protr')) 
extractAAC(x) 
# Error in strsplit(x, split = "") : non-character argument

我怎樣才能解決這個問題？

來源

2016-08-18 samooo

請檢查'STR（X）''的工作strsplit'只'字符'向量。所以你可能需要轉換成「字符」類。 – akrun

STR（x）的 1個 $ SP名單| P00750 | TPA_HUMAN：字符「MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARSYQVICRDEKTQMIYQQHQSWLRPVLRSNRVEYCWCNSGRAQCHSVPVKSCSEPRCFNGGTCQQALYFSDFVCQCPEGFAGKCCEIDTRATC」 | __truncated__ – samooo

在這種情況下做'strsplit（X [[1]]，「」）' – akrun

的原因是，「X」是一個list的length 1.我們可以提取的第一個元素，然後做strsplit

strsplit(x[[1]], "")

來源

2016-08-18 17:57:48 akrun

strsplit（x，split =「」）中的錯誤：非字符參數

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