將Bash R鏈接到RStudio，版本/封裝庫不同步

我很擔心如何鏈接/同步從Mac OSX上的bash終端訪問R的版本到R（和R庫）的版本，我在R Studio中擁有。將Bash R鏈接到RStudio，版本/封裝庫不同步

一些背景資料：

我通過下載獲得最新版本從開發者的網站作爲2016年10月9日安裝的R/R工作室。

我以前曾經在bash上安裝過R，但是那個版本是我在網上下載的3.2.5而不是3.3.1。所以如果我試圖從bash打開一個R腳本，它會啓動一個已經廢棄的RStudio版本。

爲了解決這個問題，我使用了Brew來取消舊版R的鏈接，並在bash中重新安裝R. brew unlink r brew install R

的問題：

現在，當我從終端推出的R腳本，它會打開正確的版本RStudio的，其中有一個版本：

version.string R version 3.3.1 (2016-06-21) nickname Bug in Your Hair

然而，如果在bash中，我簡單地使用$ R啓動R，我的版本爲：

R version 3.3.0 (2016-05-03) -- "Supposedly Educational"

此外，安裝在RStudio中的軟件包未鏈接。在Rstudio中，我可以正確加載包庫，例如library(tidyverse)。

在bash的$ R，上面的命令library(tidyverse)拋出一個錯誤：

Error in library(tidyverse) : there is no package called ‘tidyverse’

我想是一種鏈接R的bash的版本和Rstudio使得R-版本是相同並且使得安裝在R中的包在RStudio中被識別，並且RStudio安裝的包可以在bash R中加載。

感謝您的幫助。

來源

2016-10-10 code_user_524

默認行爲應該是R和Rstudio共享相同的版本和軟件包。我想象你遇到的問題與安裝時有過時的自制軟件版本有關。

我會建議卸載並重新安裝，因爲我無法使用最新的自制軟件的軟件包重現您的問題：由brew doctor

brew tap homebrew/science 
brew install r

我沒有提出

brew uninstall r 
brew update 
brew update # (run twice) 
brew cleanup 
brew doctor

解決任何問題安裝了Rstudio，所以我使用cask從Homebrew安裝了它 - 如果您已經從開發人員的站點安裝了Rstudio，則不需要安裝Rstudio。

brew cask install rstudio

採取這些步驟，我得到兩個R Studio和終端以下後：在我終端窗口

R version 3.3.1 (2016-06-21) -- "Bug in Your Hair" 
library(tidyverse) 
Error in library(tidyverse) : there is no package called ‘tidyverse’

在這一點上，我跑：

install.packages("tidyverse")

最後，安裝後返回R Studio：

> library(tidyverse) 
Loading tidyverse: ggplot2 
Loading tidyverse: tibble 
Loading tidyverse: tidyr 
Loading tidyverse: readr 
Loading tidyverse: purrr 
Loading tidyverse: dplyr 
Conflicts with tidy packages -------------------- 
filter(): dplyr, stats 
lag(): dplyr, stats

來源

2016-10-10 15:48:28

我相信OP指的是bash終端窗口。不是R命令行界面。 –

將Bash R鏈接到RStudio，版本/封裝庫不同步

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