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回答
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如果我理解你正確地做什麼,這是不使用data.frames的典型方式 - 通常,列應該作爲變量而不是行,並且可用的data.frame工具的主機使用這個假設。話雖這麼說,對於data.frames A
及以下B
...
A <- as.data.frame(matrix(1:12,nrow=3,ncol=4))
A
## V1 V2 V3 V4
## 1 1 4 7 10
## 2 2 5 8 11
## 3 3 6 9 12
B <- as.data.frame(matrix(2:13,nrow=3,ncol=4))
B
## V1 V2 V3 V4
## 1 2 5 8 11
## 2 3 6 9 12
## 3 4 7 10 13
...你想要做的是c(1,4,7,10)
與c(2,5,8,11)
等的於各行的2樣本t檢驗, 一直往下。你可以到達那裏
pvals <- rep(NA, nrow(A))
for(i in 1:nrow(A)) pvals[i] <- t.test(A[i,],B[i,])$p.value
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你爲什麼要這樣做?要麼以錯誤的方式使用數據幀,要麼使用不正確的t檢測。 – Consistency
我想查看正常樣本和腫瘤樣本的探針之間的差異甲基化。 –