計數數據幀中的實例數

對於X1中的每個唯一字符串，我想獲得value爲正數和負數的實例數。計數數據幀中的實例數

數據：

> head(tab_split_merge.m) 
            IsomiR logCPM  LR  PValue   FDR    X1      X2 variable  value 
1 hsa-miR-135b-5p_TATGGCTTTTCATTCCTATGTGAA 3.7839592 96.44248 9.187474e-23 2.002777e-18 hsa-miR-135b-5p TATGGCTTTTCATTCCTATGTGAA logFC 4.741782 
2 hsa-miR-135b-5p_TATGGCTTTTCATTCCTATGTGA 5.6750976 93.55073 3.959207e-22 4.315338e-18 hsa-miR-135b-5p TATGGCTTTTCATTCCTATGTGA logFC 4.105579 
3 hsa-miR-135b-5p_TATGGCTTTTCATTCCTATGTG 4.7075541 91.62360 1.048355e-21 7.617695e-18 hsa-miR-135b-5p TATGGCTTTTCATTCCTATGTG logFC 4.120676 
4 hsa-miR-21-5p_GTAGCTTATCAGACTGATGTTGACC 0.5600979 79.52288 4.766726e-19 2.597746e-15 hsa-miR-21-5p GTAGCTTATCAGACTGATGTTGACC logFC 3.811973 
5 hsa-miR-135b-3p_ATGTAGGGCTAAAAGCCATGGG 0.9542581 75.22223 4.206038e-18 1.833749e-14 hsa-miR-135b-3p ATGTAGGGCTAAAAGCCATGGG logFC 4.268764 
6 hsa-miR-497-3p_CAAACCACACTGTGGTGTTGGA 1.5307936 60.67202 6.742159e-15 2.449539e-11 hsa-miR-497-3p CAAACCACACTGTGGTGTTGGA logFC -3.126917

輸出：

mir    up down 
hsa-miR-21-5p 1 0 
hsa-miR-135b-5p 4 0 
hsa-miR-497-3p 0 1

來源

2015-07-19 BioMan

嘗試'表後使用table（變換（DF1 [C（ 'X1'， 'value'）]，value = value> 0））' – akrun

完美。請將其發佈爲答案 – BioMan

我作爲解決方案發布。如果有效，請考慮接受解決方案。 – akrun

你可以子集化數據集

table(transform(df1[c('X1', 'value')], value=value>0))

來源

2015-07-19 13:30:15 akrun

計數數據幀中的實例數

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