如何通過數據點中的R

Question

比較兩個類似的表數據點之間的區別我有一個表（DF1），看起來像這樣：

I   id col.3 col.4 col.5 col.6 col.7 col.8 
M Chr18_1369  G  G  T  G  G  G 
M Chr18_54979  G  N  A  N  G  G 
M Chr18_187626  C  T  N  T  C  C 
M Chr18_196254  C  C  G  C  N  G 
M Chr18_224569  A  A  C  N  C  C 
M Chr18_275670  T  T  C  C  T  T 

有由「N」在DF1代表的一些丟失的數據點。在填補之後，丟失的數據「N」將被一個字母替換。輸出是DF2爲：

I   id col.3 col.4 col.5 col.6 col.7 col.8 
M Chr18_1369  G  G  T  G  G  G 
M Chr18_54979  G  G  A  G  G  G 
M Chr18_187626  C  T  T  T  C  C 
M Chr18_196254  C  C  G  C  C  G 
M Chr18_224569  A  A  C  A  C  C 
M Chr18_275670  T  T  C  C  T  T 

我有另一個數據幀（DF3）

I   id col.3 col.4 col.5 col.6 col.7 col.8 
M Chr18_1369  G  G  T  G  G  G 
M Chr18_54979  G  G  A  A  G  G 
M Chr18_187626  C  T  C  T  C  C 
M Chr18_196254  C  C  G  C  C  G 
M Chr18_224569  A  A  C  C  C  C 
M Chr18_275670  T  T  C  C  T  T 

所述DF3具有相同的結構DF2但一些字符值可以是在缺少數據的相應位置不同的「d」中的「N」。例如，df2 [2,6] ==「G」，但df3 [2,6] ==「A」和df2 [3,5] ==「T」，df3 [3,5] ==「 C「... 我想計算df2和df3之間的差異率。公式是：

U <- length(which(df1 =="N", arr.ind=TRUE)) 
Diff = length(difference(df2,df3))/U 

我不知道如何獲得長度（差異（df2，df3））。我需要一個優雅的腳本來完成這項任務。先謝謝你。

Answer 1

sum（df2 == df3）

不起作用？