Procrustes分析與多個數據集

Question

我對社區對環境梯度的反應感興趣。我有4個不同類別（無脊椎動物，硅藻，水生植物和魚類）的物種數據（丰度）。而且我還有一套環境描述符（流和流域的物理化學參數）。我擁有10條信息流的所有信息。

我想計算一個Procrustes分析，以查看這些組是否以相同的方式響應環境梯度。我在環境描述符上運行了不同的RDA（每組1個RDA）和一個PCA。理想情況下，我想在我的4個RDA和1個PCA（即總共5個配置）之間運行Procrustes分析。然而，素食主義者封裝的功能procrustes只允許使用2種配置...

在同一個分析中，這5種配置有沒有辦法？

Answer 1

您需要推廣 Procrustes分析。這似乎是可用的，至少在以下[R包：形狀，factoMiner，EvoMorph，顯然在其他幾個人。

或者你可以考慮INDSCAL：看[R包smacof，多路，sensoMiner等你發現搜索[R軟件包列表。