在R Sweave（Knitr）中使用R Markdown塊

我有一個R Markdown文件，其中包含我的筆記和代碼塊。我現在想編寫一個R Sweave（Knitr）文檔來發布使用這些塊的論文。我不想剪切和粘貼大塊，而是直接給它們打電話。這樣，如果我更新大塊，我不必在兩個地方做。它似乎很簡單，但我無法弄清楚。我的代碼如下，test.rmd是我的標記文件，foo是rmd文件中的塊。在R Sweave（Knitr）中使用R Markdown塊

Test.rnw

<<Setup>>=== 
read_chunk('test.rmd') 
@ 
<<foo>>== 
@

Test.rmd

```{r foo, echo=TRUE} 
    print(summary(cars)) 
```

我會希望顯示在輸出test.rnw彙編成PDF汽車的摘要。但我不知道。任何幫助是極大的讚賞。

來源

2014-03-31 tcalderwood

你讀過幫助頁面？「注意該函數只能用於沒有被緩存的塊（塊選項cache = FALSE），並且代碼被讀取並存儲在當前會話中而不被執行（爲了實際運行代碼，必須使用一個帶有相應標籤的塊）「。 –

我以爲這就是我所做的。默認情況下，cache = FALSE，我使用了一個帶有相應標籤的塊。我的chuck代碼被稱爲foo，我使用<> ==來調用它。也就是說，除非我完全錯過了這條船。 – tcalderwood

read_chunk讀取從r腳本塊這樣稱呼purl前read_chunk：

<<Setup>>= 
knit_patterns$set(all_patterns[["md"]]) 
purl("test.Rmd") 
knit_patterns$set(all_patterns[["rnw"]]) 
read_chunk("test.R") 
@ 

<<foo>>= 
@

來源

2014-04-01 09:12:14 kohske

當我從控制檯運行purl和read_chunk時，我用我的塊獲得一個R文件。然後我複製並將您的示例粘貼到我的rnw文件中。當rnw文件被編譯成PDF時，R文件被生成，但是是空的。我確定我的目錄設置正確，文件正在被purl讀入。所以，我爲什麼要得到一個空的R文件是一個失敗。 – tcalderwood

您可能需要明確設置模式。查看已更新。 – kohske

非常感謝你！它正是我所需要的。這將使我的學習和研究變得如此簡單。再一次，非常感謝你。 – tcalderwood

在R Sweave（Knitr）中使用R Markdown塊

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