2013-02-22 49 views
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我正在尋找用於生物信息學的CGH分析的python模塊。我找到了一些工具,但他們是基於網絡的,我沒有在python中找到任何模塊來處理CGH分析也包含所有圖形。
我想在python中使用命令行模塊。用於CGH分析的python模塊

請讓我知道如果有人知道相同。

謝謝

回答

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我懷疑你會找到一個。如果您正在進行陣列工作並且想通過命令行來驅動它,請學習一些R並選擇CGH分析的許多軟件包之一。我確定有一些python/R綁定可以幫助你。

http://www.bioconductor.org/packages/2.12/bioc/html/CGHcall.html

http://www.bioconductor.org/packages/2.11/bioc/html/CGHnormaliter.html

http://www.hindawi.com/journals/cfg/2009/201325/

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但我想知道它是如何可能像Python語言沒有模塊CGH領域? – sam 2013-02-23 03:39:34

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因爲它們不是專業的統計語言。 Perl也沒有它們。事情的一個簡單的事實是R對於這類工作來說更合適和更好得到支持。使用正確的工具進行正確的工作:) – DrDanielSwan 2013-02-23 15:53:24