將源碼安裝的熊貓鏈接到自制的python

我試圖安裝python包pandas。將源碼安裝的熊貓鏈接到自制的python

我使用home-brew/easy_install/pip安裝了所有我現有的python設備，但是pip和easy_install都在pandas上失敗 - 聲稱我沒有numpy> 1.6（儘管在python numpy.__version__中返回1.6.2 ）。

儘管如此，pip install numpy --upgrade報告說我是最新的。

爲了解決這個問題，我將git克隆了源代碼，然後在我的/Library/Python/...目錄中運行python setup.py install。它似乎構建好，但是當我導入熊貓時，我收到一個錯誤，我不知道該怎麼做。

任何人都可以幫助我將編譯的庫鏈接到我現有的安裝？

錯誤如下：

dlopen(/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pandas-0.9.1.dev_5a152bd-py2.7-macosx-10.7-x86_64.egg/pandas/lib.so, 2): Symbol not found: _floatify 
    Referenced from: /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pandas-0.9.1.dev_5a152bd-py2.7-macosx-10.7-x86_64.egg/pandas/lib.so 
Expected in: flat namespace 
in /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pandas-0.9.1.dev_5a152bd-py2.7-macosx-10.7-x86_64.egg/pandas/lib.so 
Traceback (most recent call last): 
File "<stdin>", line 1, in <module> 
File "/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pandas-0.9.1.dev_5a152bd-py2.7-macosx-10.7-x86_64.egg/pandas/__init__.py", line 10, in <module> 
import pandas.lib as lib 
ImportError: dlopen(/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pandas-0.9.1.dev_5a152bd-py2.7-macosx-10.7-x86_64.egg/pandas/lib.so, 2): Symbol not found: _floatify 
Referenced from: /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pandas-0.9.1.dev_5a152bd-py2.7-macosx-10.7-x86_64.egg/pandas/lib.so 
Expected in: flat namespace 
in /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pandas-0.9.1.dev_5a152bd-py2.7-macosx-10.7-x86_64.egg/pandas/lib.so

來源

2012-11-08 ricardo

你使用的是virtualenv嗎？ – Aman

此問題的解決方案是刪除'/ System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python'中找到的numpy版本。爲了解決這個問題，我不得不'釀造卸載python'，並使用系統python來導入numpy，然後打印numpy .__ version__這確認它是舊的。我想通過'print（numpy）'確定硬殼顛簸的位置，最後'cd'進入目錄和'sudo rm -r numpy'。只有在這樣做完成後，才能「安裝pandas」工作 - 這意味着我不需要「克隆」它。 – ricardo

這是討論和解決在GitHub上：https://github.com/pydata/pandas/issues/2188。這個問題不得不由於Clang的C99行爲w.r.t.內聯C函數。

來源

2012-11-09 18:20:05

我刪除了，並git克隆新的下來，現在我看到：「提高ImportError（'C擴展未建：如果您已安裝' ImportError：C擴展未建：如果您已安裝已驗證，您不是從源碼目錄「。奇怪的是，當我嘗試和'pip install pandas'時，pip仍然無法看到我的NumPy.ip和easy_install肯定可以看到我的numpy是最新的，所以我認爲這是一個熊貓問題。慚愧，因爲我真的想讓大熊貓工作，併購買你的書友。 – ricardo

你是否在''git clone'中安裝了'python setup.py install'（pandas有C必須構建的擴展，並且你不應該從源代碼導入熊貓如果你的環境有問題，你應該考慮100％免費的Anaconda CE發行版，它包含了你需要的所有東西。 –

是的，我做了'python setup.py instal l'但我確實在'/ Library/Python/...'文件夾中執行了操作，並且在構建後我確實嘗試導入。我用'pip'來獲得'Cython'。我該怎麼做呢？ – ricardo

修復了我的MBP上的根問題（pip install pandas失敗），然後在另一個盒子上測試它 - 問題似乎是mac安裝隨附的舊版numpy和隨後的新版本之間的衝突使用pip進行安裝。熊貓看到了舊的numpy，並失敗了。

要解決這個問題，請cd到默認軟件包的位置。你可能是我的一樣：

$ cd /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/ 
$ sudo rm -r numpy 

$ sudo pip install pandas

有了這樣的方式，sudo pip install pandas爲我工作在兩個箱子。

來源

2012-12-01 23:57:20 ricardo

將源碼安裝的熊貓鏈接到自制的python

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