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我有距離的二維表中R A data.frame(從CSV進口):如何「平坦」或「崩潰」二維數據幀到R A 1D數據幀?
CP000036 CP001063 CP001368
CP000036 0 a b
CP001063 a 0 c
CP001368 b c 0
我想 「壓扁」 了。我有一個軸的第一欄的值,其他軸的在第二欄的值,然後在第三欄的距離:
Genome1 Genome2 Dist
CP000036 CP001063 a
CP000036 CP001368 b
CP001063 CP001368 c
以上是理想的,但它是完全沒有重複使得在輸入矩陣中的每個單元都有它自己的行:
Genome1 Genome2 Dist
CP000036 CP000036 0
CP000036 CP001063 a
CP000036 CP001368 b
CP001063 CP000036 a
CP001063 CP001063 0
CP001063 CP001368 c
CP001368 CP000036 b
CP001368 CP001063 c
CP001368 CP001368 0
下面是一個例子3x3矩陣,但我的數據集我要大得多(約2000×2000)。我會做這在Excel中,但我需要約3個百萬行的輸出,而Excel的最大值是約1萬元。
這個問題是非常相似的 「如何‘扁平化’或‘崩潰’一2D Excel表格到1D?」 1
as.data.frame.table? – 2013-04-25 17:36:43