有沒有辦法壓縮DICOM數據？

說，我有一個文件夾中的.dicom文件的序列。累計大小約爲100 Mb。這是很多數據。我試圖將數據轉換爲.nrrd和.nii，但這些文件具有轉換的.dicom文件的總結大小（這是相當可預測的，儘管.nrrd已被壓縮爲gzip）。我想知道，如果有一個文件格式，會給我更少的尺寸，或者只是一種方法來解決這個問題。也許，.vtk，或其他（不知道它可以工作）。提前致謝。有沒有辦法壓縮DICOM數據？

來源

2012-10-03 John Doe

對於那些熟悉相關標準的人來說，嚴格解釋'100mb'就意味着「百毫比特」，這是不符合任何人標準的大量數據。如果你的意思是「一百兆」甚至「一百兆」，我們很多人仍然會認爲「呃，實際上不是那麼多的數據」。最後，這裏有一個參考可能實際上有助於http://www.mccauslandcenter.sc.edu/mricro/dicom/index.html –

@HighPerformanceMark這沒什麼幫助，但感謝提及，我編輯了這個問題。 –

DICOM支持壓縮文件內的像素數據。 DICOM的想法是，從它所擁有的像素數據的角度來看，它是格式不可知的。

DICOM可以保存原始像素數據，也可以保存JPEG壓縮的像素數據以及其他許多格式。 DICOM文件的傳輸語法標籤爲您提供DICOM內像素數據的壓縮協議。

首先要弄清楚你是否需要無損或有損壓縮。如果有損，有很多選擇，並且壓縮比在某些方面相當高 - 權衡是您失去了保真度，並且圖像可能不足以用於診斷目的。還有無損壓縮方案 - 如JPEG2000，RLE甚至JPEG-LS。這些將壓縮像素數據，但保留診斷質量而不會降低圖像質量。

您也可以壓縮文件，如果是原始文件，應該會產生非常好的結果。你想用這些壓縮的DICOM做什麼？

來源

2012-10-05 06:39:48

謝謝你的回答。我打算在網絡應用程序中使用文件，但決定部分使用這些數據。 –

如果您將它們用於Web應用程序，則可能只想從DICOM中提取圖像數據並將該數據保存爲JPEG。 DCMTK工具包（http://dicom.offis.de/dcmtk.php.en）對將圖像數據從DICOM提取到JPEG（甚至有一個命令行工具來執行此操作）有很好的支持。 –

哈，好吧，我很高興，但它是一個3D可視化:) –

有沒有辦法壓縮DICOM數據？

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