的R - 改變自己的映射與其他值

Question

我是新來的R和我會在我的研究活動:)

的問題是使用它的基礎上，矩陣的列名：

• 我具有矩陣

  gene.names.as.matrix

head(gene.names.as.matrix) 

    EIF4E ULK3... RPS6 EIF4EBP1 STRADA CAB39 BRAF 
[1,]  0  0 0  0  0  0 0  
[2,]  0  0 0  0  0  0 0  
[3,]  0  0 0  0  0  0 0  
[4,]  0  0 0  0  0  0 0  
[5,]  0  0 0  0  0  0 0  
[6,]  0  0 0  0  0  0 0 

帶有許多行和其他列，爲簡潔起見，此處不顯示。

• 我還有一個矩陣

  gene.id.map

head(gene.id.map) 

     gene.symbol gene.id 
1977 "EIF4E"  "1977" 
25989 "ULK3..." "25989" 
6194 "RPS6"  "6194" 
1978 "EIF4EBP1" "1978" 
92335 "STRADA" "92335" 
51719 "CAB39"  "51719" 

• 我想改變的

  列名

  存在於基體中的值的基礎

  gene.id.map 
  

  因此上gene.names.as.matrix

，結果矩陣應該是這樣的：

 1977 25989 6194 [...] 
[1,]  0  0 0  
[2,]  0  0 0  
[3,]  0  0 0 
[...] 

謝謝！

Answer 1

你可以這樣做：

colnames(gene.names.as.matrix)[match(gene.id.map[,1], colnames(gene.names.as.matrix))] <- genes.id.map[,2][match(gene.id.map[,1], colnames(gene.names.as.matrix))] 

gene.names.as.matrix 
#  1977 25989 6194 1978 92335 51719 BRAF 
#[1,]  0  0  0  0  0  0 0 
#[2,]  0  0  0  0  0  0 0 
#[3,]  0  0  0  0  0  0 0 
#[4,]  0  0  0  0  0  0 0 
#[5,]  0  0  0  0  0  0 0 
#[6,]  0  0  0  0  0  0 0