重新排列表格格式

我想抓住「-」之後的部分，並將它與下面的字母串組合成一個製表符輸出。我嘗試了cut -d "*-" -f 2 <<< "$your_str"之類的東西，但我不確定如何做整個洗牌。重新排列表格格式

輸入：

>1-395652 
TATTGCACTTGTCCCGGCCTGT 
>2-369990 
TATTGCACTCGTCCCGGCCTCC 
>3-132234 
TATTGCACTCGTCCCGGCCTC 
>4-122014 
TATTGCACTTGTCCCGGCCTGTAA 
>5-118616

輸出：

TATTGCACTTGTCCCGGCCTGT 395652 
TATTGCACTCGTCCCGGCCTCC 369990

來源

2017-04-02 user2300940

您使用什麼標準來選擇輸出哪些行？最終輸入行應該輸出什麼？ –

awk來救援！

awk -F- '/^>/{k=$2; next} {print $0, k}' file

來源

2017-04-02 16:48:15 karakfa

是這個表格輸出嗎？ – user2300940

隨着GNU sed的：

sed -nE 'N;s/.*-([0-9]+)\n(.*)/\2\t\1/p' file

輸出：

 
TATTGCACTTGTCCCGGCCTGT 395652 
TATTGCACTCGTCCCGGCCTCC 369990 
TATTGCACTCGTCCCGGCCTC 132234 
TATTGCACTTGTCCCGGCCTGTAA  122014

來源

2017-04-02 17:26:09 Cyrus

sed便攜式：

sed -n 's/.*-//;x;n;G;s/\n/ /p' inputfile

輸出：

TATTGCACTTGTCCCGGCCTGT 395652 
TATTGCACTCGTCCCGGCCTCC 369990 
TATTGCACTCGTCCCGGCCTC 132234 
TATTGCACTTGTCCCGGCCTGTAA 122014

來源

2017-04-02 17:26:34 agc

重新排列表格格式

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