管道破壞返回

Question

新手問題在這裏;

我有以下兩個函數 - 第一個，'read_fq_entry'，從subprocess.Popen（該系統調用zcat並管道它）讀取行，並一次返回四行作爲列表。

第二個'stream_fq'從第一個獲取返回的輸出，並且暫時打印它。 （最終我將被隨機抽樣套系，並將其寫入文件

的問題是，在第一個函數的返回打破了管道 - 如何不做到這一點任何想法??

def read_fq_entry(process): 

     while (True): 
      name = process.stdout.readline()  
      seq = process.stdout.readline() 
      strand = process.stdout.readline() 
      qual = process.stdout.readline() 

      if (not name or name == '') : 
       return [] 

      return [name, seq, strand, qual] 


def stream_fq(infile1, infile2, Nr_of_reads): 


     proc1 = subprocess.Popen("zcat " + infile1, stdout=subprocess.PIPE, shell=True) 
     proc2 = subprocess.Popen("zcat " + infile2, stdout=subprocess.PIPE, shell=True) 

     while (True): 

      fq_1_entry = read_fq_entry(proc1) 
      fq_2_entry = read_fq_entry(proc2) 
      print fq_1_entry 
      print fq_2_entry 

Answer 1

線return [name, seq, strand, qual]是while True:循環中，你應該把它移到一個級別，或也許改變return聲明爲yield語句。