問題上安裝更新後，服務器軟件包2.15

我有一個反覆出現的問題安裝軟件包，往往是這樣的：問題上安裝更新後，服務器軟件包2.15

> install.packages("Biobase") 
Installing package(s) into ‘/usr/local/lib/R/site-library’ 
(as ‘lib’ is unspecified) 
Warning in install.packages("Biobase") : 
    'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' is not writable 
Would you like to create a personal library 
~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15 
to install packages into? (y/n) y 
--- Please select a CRAN mirror for use in this session --- 
Loading Tcl/Tk interface ... done 
Warning message: 
package ‘Biobase’ is not available (for R version 2.15.0)

我Sys.info()如下：

> Sys.info() 
            sysname 
            "Linux" 
            release 
          "2.6.32-40-server" 
            version 
"#87-Ubuntu SMP Tue Mar 6 02:10:02 UTC 2012" 
            nodename 
            "******" 
            machine 
            "x86_64" 
             login 
             "**" 
             user 
             "**" 
           effective_user 
             "**"

是錯誤package ‘Biobase’ is not available (for R version 2.15.0)由於我必須將其安裝在個人圖書館中（顯然在我工作的服務器上，通常的圖書館是不可寫的）的事實？我該如何解決這個問題，因爲我似乎在任何時候嘗試安裝軟件包時都會得到相同的「不適用於2.15」錯誤。

來源

2012-04-24 user1231088

該包裝可在Bioconductor上使用，不通過CRAN。這是你如何安裝它：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R") 
biocLite("Biobase")

更多信息，請參見Bioconductor。

來源

2012-04-24 16:00:10 Tommy

我爲其他任何可能偶然遇到此舊帖子的人添加以下解決方案。

問題的根本原因是R安裝庫的目錄的所有權/權限。從相關帖子引用：

「該目錄由root：staff和模式2775擁有，或'用戶和組讀寫，其他只讀'。」（Dirk Eddelbuettel）

欲瞭解更多詳情以及如何糾正此問題，請參考此thread。

來源

2013-12-04 16:58:23 Stan

問題上安裝更新後，服務器軟件包2.15

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