手動安裝pysam錯誤：「ImportError：No module named version」

我想手動安裝pysam，因爲我在沒有互聯網連接的集羣上工作，而且我沒有管理員權限（因此通過conda做到這一點是不可能的，我曾嘗試過）。我已經從開發人員的存儲庫（https://github.com/pysam-developers/pysam/archive/master.zip）下載了所有壓縮文件，然後將它們傳輸到羣集中的我的目錄中。手動安裝pysam錯誤：「ImportError：No module named version」

我已經運行（如說明https://github.com/pysam-developers/pysam/blob/master/INSTALL表示）試圖從解壓縮存儲庫中手動安裝：

python path/to/pysam-master/setup.py build

，但我得到了以下錯誤：

# pysam: cython is available - using cythonize if necessary 
Traceback (most recent call last): 
    File "path/to/pysam-master/setup.py", line 166, in <module> 
    import version 
ImportError: No module named version

線165，166 setup.py文件中的167個是：

165. sys.path.insert(0, "pysam") 
166. import version 
167.version = version.__version__

Unfort非常地，我的知識只帶走了我至今。是否有必要修改setup.py文件？

我的系統規格：

的Python 2.7.13 ::蟒蛇，公司
CentOS版本6.5
Linux的2.6.32-431.20.5.el6.x86_64

來源

2017-09-27 Sergio.pv

此安裝程序不安裝依賴項，您必須手動安裝它們，因爲您沒有Internet。 – dalonlobo

爲了問題的緣故，您是否僞造了setup.py文件的路徑，或者您是否真的在運行'python path/to/pysam-master/setup.py build'？ –

我只運行python path/to/pysam-master/setup.py build –

version.py位於path/to/pysam-master/pysam中。該腳本使用操作系統的模塊導入之前到pysam目錄添加到環境的工作目錄：

sys.path.insert(0, "pysam")

所以，這個特定的問題，應通過更換「pysam」在

sys.path.insert(0, "pysam")

解決

與pysam目錄的完整路徑。

來源

2017-09-27 12:32:34 Sudix

安裝運行，直到它崩潰：error：command'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc'失敗，退出狀態爲1 –

我會將此到一個單獨的問題 –

由於塞爾吉奧還沒有回答，如果你還沒有找到答案：請嘗試在「setup.py build」調用中明確更改活動目錄，因此只需輸入命令「setup .py build「 – Sudix

手動安裝pysam錯誤：「ImportError：No module named version」

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