2010-04-21 44 views
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R有一個有用的函數pairs,它提供了數據集中變量之間成對連接圖的很好矩陣。所得的情節看起來類似於下圖,從this blog post複製:matplotlib類似的R````

pairs

有沒有準備基於Python的matplolib使用功能?我搜查了它的gallery,但找不到類似我需要的東西。從技術上講,這應該是一項簡單的任務,但對所有可能的案例,標籤,標題等的適當處理是非常乏味的。

UPDATE請參閱下面我的答案,以快速和骯髒的近似值。

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Seaborn有這個,請參閱:http://seaborn.pydata.org/generated/seaborn。 pairplot.html – 2017-09-14 19:04:37

回答

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Pandas有一個內置的功能scatter_matrixsource code),它是這樣的。

import numpy as np 
import pandas as pd 
import matplotlib.pyplot as plt 

df = pd.DataFrame(np.random.randn(1000, 4), columns=['A','B','C','D']) 
axes = pd.tools.plotting.scatter_matrix(df, alpha=0.2) 
plt.tight_layout() 
plt.savefig('scatter_matrix.png') 

scatter_matrix.png

然而,它是特定pandas(但也可使用作爲起點)。

還有一些R像大熊貓的情節。看看docs

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據我所知,沒有這樣的隨時可用的功能。

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快速和骯髒的接近我的需求:

def pair(data, labels=None): 
    """ Generate something similar to R `pair` """ 

    nVariables = data.shape[1] 
    if labels is None: 
     labels = ['var%d'%i for i in range(nVariables)] 
    fig = pl.figure() 
    for i in range(nVariables): 
     for j in range(nVariables): 
      nSub = i * nVariables + j + 1 
      ax = fig.add_subplot(nVariables, nVariables, nSub) 
      if i == j: 
       ax.hist(data[:,i]) 
       ax.set_title(labels[i]) 
      else: 
       ax.plot(data[:,i], data[:,j], '.k') 

    return fig 

上面的代碼特此發佈到公共領域

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對我來說,在基本模塊代碼中有額外的價值。這非常明確,我將把它作爲數據處理任務的指導。一個問題:「數據」可能是什麼對象類型? – Merlin 2017-11-22 05:00:55

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在最新版本的matplotlib的subplots功能(至少是1.4),使這是一個有點容易:

def pairs(data, names): 
    "Quick&dirty scatterplot matrix" 
    d = len(data) 
    fig, axes = plt.subplots(nrows=d, ncols=d, sharex='col', sharey='row') 
    for i in range(d): 
     for j in range(d): 
      ax = axes[i,j] 
      if i == j: 
       ax.text(0.5, 0.5, names[i], transform=ax.transAxes, 
         horizontalalignment='center', verticalalignment='center', 
         fontsize=16) 
      else: 
       ax.scatter(data[j], data[i], s=10) 
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如果應用於scikit-learn的數據集標準,則「len(data)」將返回觀察值的數量,而不是變量的數量。 'd = data.shape [1]'是這種情況下的解決方案。 – 2016-09-18 12:14:34