操縱列文在UNIX

test.txt的製表符分隔文本文件

chrom1 start1 end1 
    2 8828280 8828281 
    2 8828952 8828953 
    2 115627275 115627276 
    3 63945545 63945546 
    3 109753479 109753480 
    3 109753640 109753641 
    4 31116488 31116489 
    4 31116523 31116524

我怎樣才能做到以下任務在UNIX殼 -

將列名「chrom1」更改爲「chr」和
add「chr」「在」chr「列中的每個值前面。

輸出應該看起來像 -

chr start1 end1 
chr2 8828280 8828281 
chr2 8828952 8828953 
chr2 115627275 115627276 
chr3 63945545 63945546 
chr3 109753479 109753480 
chr3 109753640 109753641 
chr4 31116488 31116489 
chr4 31116523 31116524

來源

2016-08-04 panbar

您可以使用AWK：

awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {$1 = "chr" (NR==1 ? "" : $1)} 1' file 

chr start1  end1 
chr2 8828280 8828281 
chr2 8828952 8828953 
chr2 115627275 115627276 
chr3 63945545 63945546 
chr3 109753479 109753480 
chr3 109753640 109753641 
chr4 31116488 31116489 
chr4 31116523 31116524

來源

2016-08-04 16:32:11 anubhava

謝謝@anubhava。如果我想在同一個文件的第4列上做同樣的兩個更改，你能建議怎麼做嗎？ – panbar

對不起，我不明白你的問題只提到第一欄。 – anubhava

如果必須在第4列而不是第1列進行更改 – panbar

操縱列文在UNIX

回答

相關問題